Il s'agit de l'application Linux nommée TI2BioP à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous TI2BioP_ver_3.0.zip. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée TI2BioP pour fonctionner gratuitement sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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TI2BioP pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
TI2BioP permet principalement le calcul d'indices topologiques (moments spectraux) dérivés de structures 2D inférées et artificielles d'ADN, d'ARN et de protéines permettant d'effectuer une corrélation structure-fonction indépendamment des alignements de séquences.TI2BioP version 3.0 est une plateforme python avec une interface graphique conçue pour Windows, Linux et Mac OS.
Features
- Les séquences d'ADN/ARN et de protéines sont disposées dans un espace 2D artificiel
- Les informations de repliement de l'ARN 2D contenues dans Xfasta et les CT sont importées
- Les moments spectraux en tant qu'indices topologiques (TI) sont calculés à partir de graphiques d'ADN/ARN et de protéines artificiels 2D et plus précis
- Les TI sont utilisés pour développer des modèles sans alignement (AF) pour l'annotation fonctionnelle/structurelle
- Les TI sont également utilisés pour estimer les distances (AF) pour les analyses phylogénétiques
Audience
Science/Recherche, Éducation
Interface utilisateur
Gnome, Win32 (MS Windows)
Langage de programmation
Python, Delphes/Kylix
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/ti2biop/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
