ऑटोडॉकटूल - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

adt - AutoDockTools, AutoDock के लिए एक ग्राफिकल फ्रंट-एंड

SYNOPSIS

रनएडीटी [विकल्पों]

वर्णन

यह मैनुअल पृष्ठ द्वारा प्रदान किए गए आउटपुट का लगभग शाब्दिक अनुवाद है रनएडीटी -h
आदेश।

विकल्प

विकल्पों का सारांश नीचे दिया गया है। पूर्ण विवरण के लिए, देखें
ट्यूटोरियल और प्रलेखन जो ऑनलाइन उपलब्ध है।

-एच, --मदद
विकल्पों का सारांश दिखाएं।

-a or --फिर
लास्टलॉग फ़ाइल वापस चलाएं

--ओवरराइटलॉग
लॉग फ़ाइल को अधिलेखित करें

--अद्वितीयलोग
एक अद्वितीय नाम के साथ एक लॉग फ़ाइल बनाएँ

--नोलोग
लॉगिंग बंद करें

--नोस्पलैश
स्प्लैश स्क्रीन बंद करें

--मर GUI ईवेंट लूप प्रारंभ न करें

--अनुकूलक पट्टिका
उपयोगकर्ता निर्दिष्ट फ़ाइल चलाएँ

--लिब पैकेज का नाम
आदेशों की एक पुस्तकालय जोड़ें

-v r, --दृष्टि रन
कमांड लाइन पर विज़न नेटवर्क चलाएं

-v o, --दृष्टि एक बार
दृष्टि नेटवर्क चलाएं और एडीटी से बाहर निकलें

-d or --dmode मोड
एक प्रदर्शन मोड निर्दिष्ट करें
मोड डिस्प्ले मोड का कोई भी संयोजन हो सकता है
'सीपीके': सीपीके
'लाइनें': लाइन्स
'एसएस': माध्यमिक संरचना रिबन
'एसबी' : लाठी और गेंद
'लाइसेंस': नद्यपान
'एमएस': आणविक सतह
'सीए': सी-अल्फा ट्रेस
'बीटी': बैकबोन ट्रेस
'एसपी': सीए-तख़्ता
'sssb' : प्रोटीन, स्टिक्स और बॉल्स के लिए द्वितीयक संरचना
बांड के बिना अन्य अवशेषों के लिए बांड लाइनों के साथ अन्य अवशेष

-c or --कमोड मोड
एक डिसप्ले मोड रंग योजना निर्दिष्ट करें:
'सीए': परमाणु द्वारा रंग
'करोड़' : अवशेषों से रंग (रसमोल योजना)
'सीसी': श्रृंखला द्वारा रंग
'सेमी' : अणु द्वारा रंग
'सीडीजी': डेविड गुडसेल की योजना का उपयोग कर रंग
'सीएस': शेपली स्कीम का उपयोग करके रंग अवशेष
'सीएसएस': माध्यमिक संरचना तत्व द्वारा रंग

उदाहरण:

प्रोटीन को रिबन के रूप में, गैर प्रोटीन को छड़ियों और गेंदों के रूप में और परमाणु प्रकार द्वारा रंग प्रदर्शित करें

adt -i --dmode sssb --cmode cr myprot.pdb

adt -i -m sssb -c cr myprot.pdb

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