यह कमांड bp_process_sgdp है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
bp_process_sgd.pl - SGD एनोटेशन फ़्लैट फ़ाइलों को उपयुक्त संस्करण में बदलें
जेनेरिक जीनोम ब्राउज़र
SYNOPSIS
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > Yeast.gff
वर्णन
यह स्क्रिप्ट स्थित SGD अनुक्रम एनोटेशन फ़्लैट फ़ाइलों की मालिश करती है
ftp://genome-ftp.stanford.edu/pub/yeast/data_dump/feature/chromosomal_features.tab एक में
जेनेरिक जीनोम ब्राउज़र द्वारा प्रदर्शन के लिए उपयुक्त जीएफएफ प्रारूप का संस्करण।
इस स्क्रिप्ट का उपयोग करने के लिए, सूचीबद्ध FTP साइट से SGD chromosomal_features.tab फ़ाइल प्राप्त करें
ऊपर, और निम्न आदेश चलाएँ:
% bp_process_sgd.pl chromosomal_features.tab > Yeast.gff
Yeast.gff फ़ाइल को निम्नलिखित का उपयोग करके Bio::DB::GFF डेटाबेस में लोड किया जा सकता है
आदेश:
% बल्क_लोड_जीएफएफ.पीएल -डी ख़मीर.gff
onworks.net सेवाओं का उपयोग करके bp_process_sgdp का ऑनलाइन उपयोग करें