यह कमांड मिराबेट है जिसे हमारे कई मुफ्त ऑनलाइन वर्कस्टेशन जैसे कि उबंटू ऑनलाइन, फेडोरा ऑनलाइन, विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैक ओएस ऑनलाइन एमुलेटर का उपयोग करके ऑनवर्क्स फ्री होस्टिंग प्रदाता में चलाया जा सकता है।
कार्यक्रम:
नाम
मिराबैत - पढ़े गए संग्रह से पठन का चयन करें
SYNOPSIS
मीराबैत [-f ] [-t [-टी ...]] [-इक्लोर] बैटफ़ाइल इनफ़ाइल
वर्णन
मीराबैत एक पढ़े गए संग्रह से उन पाठों का चयन करता है जो आंशिक रूप से समान या बराबर होते हैं
अनुक्रमों को लक्ष्य चारा के रूप में परिभाषित किया गया है। समानता को उपयोगकर्ता-समायोज्य ढूंढकर परिभाषित किया गया है
सामान्य k-mers की संख्या (k लगातार आधारों का क्रम) जो चारा में समान हैं
अनुक्रम और स्क्रीन किए गए अनुक्रमों का चयन किया जाना है, या तो आगे या पीछे
पूरक दिशा.
विकल्प
-f
इस प्रकार की प्रोजेक्ट फाइलों को लोड करें, जहां से टाइप है:
सीएएफ से सीएएफ अनुक्रम
एमएएफ से माफ अनुक्रम
PHD से पीएचडी अनुक्रम
जीबीएफ से जीबीएफ अनुक्रम
FASTA से fasta अनुक्रम
FASTQ से fastq अनुक्रम
-t
इस प्रकार के अनुक्रम लिखें (एकाधिक उल्लेख)। -t अनुमति दी जाती है):
फास्टा से फास्टा अनुक्रम
FASTQ के लिए fastq अनुक्रम
सीएएफ के लिए सीएएफ अनुक्रम
एमएएफ के लिए एमएएफ अनुक्रम
टेक्स्ट फ़ाइल में txt अनुक्रम नाम
-k के-मेर, आधारों में चारे की लंबाई (<32, डिफ़ॉल्ट=31)
-n न्यूनतम. आवश्यक के-मेर चारा की संख्या (डिफ़ॉल्ट=1)
-i उलटा हिट: केवल ऐसे अनुक्रम लिखता है जो चारा नहीं मारते
-r विपरीत पूरक दिशा की कोई जाँच नहीं
-o Fastq गुणवत्ता ऑफ़सेट (केवल के लिए) -f = 'फास्टक') FASTQ में गुणवत्ता मूल्यों की ऑफसेट
फ़ाइल। डिफ़ॉल्ट: 33 0 का मान स्वचालित रूप से पहचानने का प्रयास करता है।
-f
इस प्रकार की प्रोजेक्ट फाइलों को लोड करें, जहां से टाइप है:
सीएएफ से सीएएफ अनुक्रम
एमएएफ से माफ अनुक्रम
PHD से पीएचडी अनुक्रम
जीबीएफ से जीबीएफ अनुक्रम
FASTA से fasta अनुक्रम
FASTQ से fastq अनुक्रम
-t
इस प्रकार के अनुक्रम लिखें (एकाधिक उल्लेख)। -t अनुमति दी जाती है):
फास्टा से फास्टा अनुक्रम
FASTQ के लिए fastq अनुक्रम
सीएएफ के लिए सीएएफ अनुक्रम
एमएएफ के लिए एमएएफ अनुक्रम
टेक्स्ट फ़ाइल में txt अनुक्रम नाम
-k के-मेर, आधारों में चारे की लंबाई (<32, डिफ़ॉल्ट=31)
-n न्यूनतम. आवश्यक के-मेर चारा की संख्या (डिफ़ॉल्ट=1)
-i उलटा हिट: केवल ऐसे अनुक्रम लिखता है जो चारा नहीं मारते
-r विपरीत पूरक दिशा की कोई जाँच नहीं
-o Fastq गुणवत्ता ऑफ़सेट (केवल के लिए) -f = 'फास्टक') FASTQ में गुणवत्ता मूल्यों की ऑफसेट
फ़ाइल। डिफ़ॉल्ट: 33 0 का मान स्वचालित रूप से पहचानने का प्रयास करता है।
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