यह GMcloser नाम का लिनक्स ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को GMcloser-1.6.2.tar.gz के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
GMcloser नाम के इस ऐप को OnWorks के साथ मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
GMcloser
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वर्णन
जीएमक्लोजर स्कैफोल्ड असेंबलियों में मौजूद अंतरालों को भरता है और बंद करता है, विशेष रूप से अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (एनजीएस) रीडिंग के साथ पूरे जीनोम के डे नोवो असेंबली द्वारा उत्पन्न अंतरालों को। अन्य गैप-क्लोजिंग टूल के विपरीत, जो केवल एनजीएस रीड्स का उपयोग करते हैं, जीएमक्लोजर गैप को बंद करने के लिए अनुक्रम के रूप में प्रीअसेंबल किए गए कॉन्टिग सेट या लंबे रीड सेट का उपयोग करता है और गैप की सटीकता और दक्षता में सुधार के लिए पेयर-एंड (पीई) रीड और एक संभावना-आधारित एल्गोरिदम का उपयोग करता है। समापन. अलग-अलग कॉन्टिग सेट के साथ क्रमिक उपचार द्वारा गैप क्लोजर की दक्षता को बढ़ाया जा सकता है।एक साथ दिया गया पैकेज, GMvalue, कंटिग्स और स्कैफोल्ड्स में मिसअसेंबली साइटों को निर्धारित करने के लिए एक उपकरण है। अन्य संबंधित उपकरणों के विपरीत, GMvalue कई विकल्पों के साथ मिसअसेंबली श्रेणियों को परिभाषित कर सकता है, और इसे बड़े आकार के जीनोम की असेंबली पर लागू किया जा सकता है। -e विकल्प का उपयोग करके, GMvalue गलत असेंबलियों को विभाजित या सही करके त्रुटि-मुक्त असेंबली भी उत्पन्न करता है।
यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/gmcloser/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।
