Ini adalah perintah bowtie2-inspect-s yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
bowtie2-inspect-s - mengekstrak informasi dari indeks bowtie2
RINGKASAN
bowtie2-inspeksi [Pilihan]*
DESKRIPSI
Bowtie 2 versi 2.2.6 oleh Ben Langmead (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)
nama file bt2 dikurangi trailing .1.bt2/.2.bt2
Secara default, mencetak catatan FASTA dari urutan nukleotida yang diindeks ke standar
keluar. Dengan -n, hanya mencetak nama. Dengan -s, hanya mencetak ringkasan indeks
parameter dan urutan. Dengan -e, mempertahankan warna jika ada.
PILIHAN
-a/--lintas
Jumlah karakter dalam output FASTA (default: 60)
-n//-nama
Cetak nama urutan referensi saja
-s/--Ringkasan
Ringkasan cetak termasuk. ref nama, panjang, indeks properti
-e//bt2-ref
Rekonstruksi referensi dari .bt2 (lambat, mempertahankan warna)
-v//-verbose
Output verbose (untuk debugging)
-h/--Tolong
cetak deskripsi rinci alat dan opsinya
--membantu cetak pesan penggunaan ini
Gunakan bowtie2-inspect-s online menggunakan layanan onworks.net