Ini adalah aplikasi Linux bernama EigenMS untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai EigenMS.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan online aplikasi bernama EigenMS ini untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
EigenMS untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI:
EigenMS adalah metode normalisasi yang diimplementasikan di R (dan versi yang lebih lama di Matlab) tersedia sebagai satu set dua fungsi yang harus digunakan secara berurutan.Silahkan download file EigenMS.zip (versi terbaru).
Versi terbaru yang diunggah pada Oktober 2017 memiliki perbaikan bug untuk normalisasi kelompok perlakuan tunggal.
Penskalaan ulang telah dihilangkan dari tahun 2015.
EigenMS menggunakan SVD untuk mendeteksi tren bias dalam data dan menghilangkannya. EigenMS menghilangkan efek dari faktor yang diketahui dan tidak diketahui dan dapat digunakan untuk platform -omic apa pun.
Kami telah menunjukkan kegunaannya dalam LC-MS/MS dan metabolomik dalam dua makalah berikut:
1) PMID: 19602524. "Normalisasi intensitas puncak dalam proteomik berbasis MS bottom-up menggunakan dekomposisi nilai tunggal".
Karpievitch YV, Taverner T, Adkins JN, Callister SJ, Anderson GA, Smith RD, Dabney AR.
Bioinformatika 2009
2) "normalisasi data Metabolomik dengan EigenMS"
Karpievitch YV, Nicolic SB, Wilson R, Sharman JE, Edwards LM.
PLoS Satu 2014
Para penonton
Sains/Penelitian
Bahasa Pemrograman
MATLAB, S/R
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/eigenms/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.