bowtie2-inspect-s - Online nel cloud

Questo è il comando bowtie2-inspect-s che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS

PROGRAMMA:

NOME


bowtie2-inspect-s - estrae le informazioni da un indice bowtie2

SINOSSI


papillon2-inspect [Opzioni]*

DESCRIZIONE


Bowtie 2 versione 2.2.6 di Ben Langmead (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)


bt2 nome file meno finale .1.bt2/.2.bt2

Per impostazione predefinita, stampa i record FASTA delle sequenze nucleotidiche indicizzate sullo standard
fuori. Insieme a -n, stampa solo i nomi. Insieme a -s, stampa solo un riepilogo dell'indice
parametri e sequenze. Insieme a -e, conserva i colori se applicabile.

VERSIONI


-a/--attraverso
Numero di caratteri nell'output FASTA (predefinito: 60)

-n/--nomi
Stampa solo i nomi delle sequenze di riferimento

-s/--riepilogo
Stampa riepilogo incl. nomi di riferimento, lunghezze, proprietà dell'indice

-e//-bt2-ref
Ricostruisci il riferimento da .bt2 (lento, conserva i colori)

-v/--prolisso
Output dettagliato (per il debug)

-h/--aiuto
stampa una descrizione dettagliata dello strumento e delle sue opzioni

--Aiuto stampa questo messaggio di utilizzo

Usa bowtie2-inspect-s online utilizzando i servizi onworks.net



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