cmtk-mcwarp: online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mcwarp - Registrazione non rigida multicanale

SINOSSI

mcwarp [opzioni] mcaffineOutput

DESCRIZIONE

Registrazione di immagini B-spline non rigide multicanale mediante istogramma o covarianza
misure congiunte di entropia basate

VERSIONI

Global Kit di strumenti Opzioni (questi sono condiviso by contro tutti i CMTK utensili)
--Aiuto
Scrivere l'elenco delle opzioni di base della riga di comando nell'output standard.

--aiuto-tutti
Scrivere l'elenco completo delle opzioni della riga di comando di base e avanzate nell'output standard.

--wiki
Scrivi l'elenco delle opzioni della riga di comando nell'output standard nel markup di MediaWiki.

--uomo
Scrivi il sorgente della pagina man nel markup 'nroff' sullo standard output.

--versione
Scrivi la versione del toolkit nell'output standard.

--eco
Scrive la riga di comando corrente nell'output standard.

--livello-verboso
Imposta il livello di verbosità.

--verboso, -v
Incrementa il livello di verbosità di 1 (deprecato; supportato per compatibilità con le versioni precedenti).

--thread
Imposta il numero massimo di thread paralleli (per thread POSIX e OpenMP).

Principale Opzioni
--out-archivio , -o
Percorso dell'archivio di output. [Predefinito: NESSUNO]

--downsample-da , -d
Fattore di downsampling iniziale [1]. [Predefinito: 1]

--downsample-to , -D
Fattore di downsampling finale [1]. [Predefinito: 1]

--sottocampione-media
Downsampling utilizzando la media della finestra scorrevole (impostazione predefinita: disattivata)) [Predefinito: 0]

--liscio
Sigma del kernel di livellamento gaussiano in multipli della dimensione in pixel dell'immagine del modello
[predefinito: disattivato] ) [Predefinito: 0]

--spaziatura della griglia
Spaziatura iniziale della griglia dei punti di controllo in mm. [Predefinito: 40]

--spaziatura-griglia-esatta
Spaziatura iniziale esatta della griglia, anche se non corrisponde al FOV dell'immagine. [Predefinito: Disabilitato]

--refine-griglia
Numero di perfezionamenti della griglia dei punti di controllo. [Predefinito: 0]

--delay-refine-grid
Ritarda il perfezionamento della griglia dei punti di controllo fino a dopo il perfezionamento dei pixel.

--adaptive-fix-thresh-factor
Fattore di soglia di intensità [0..1] per la fissazione dei parametri adattivi. [predefinito: 0 - no
fissaggio] [Predefinito: 0]

--adaptive-fix-thresh-factor-entropia
Fattore di soglia dell'entropia [0..1] per la fissazione dei parametri adattivi. [predefinito: 0 - no
fissaggio] [Predefinito: Disabilitato]

--fix-warp-x
Correggi la trasformazione (non deformare) nella direzione x.

--fix-warp-y
Correggi la trasformazione (non deformare) nella direzione y.

--fix-warp-z
Correggi la trasformazione (non deformare) nella direzione z.

--jacobian-vincolo-peso
Peso per il vincolo di conservazione del volume Jacobiano [Predefinito: 0]

--istogrammi, -H
Utilizza istogrammi multidimensionali per calcolare le entropie [default. [Questo is , il
predefinito]

--covarianza, -C
Utilizzare i determinanti della matrice di covarianza per calcolare le entropie.

--cubo, -c
Usa interpolazione cubica [impostazione predefinita: lineare]

--mi Utilizza la metrica standard delle informazioni reciproche [impostazione predefinita] [Questo is , il predefinito]

--nmi
Utilizzare la metrica di informazione reciproca normalizzata

--correzione dell'intensità, -I
Correggere le intensità dell'immagine utilizzando la trasformazione locale Jacobiana per preservare il totale
segnale

--dimensione del passo iniziale
Dimensione iniziale del passaggio dell'ottimizzatore in pixel. [Predefinito: 1]

--dimensione del passaggio finale
Dimensione iniziale del passaggio dell'ottimizzatore in pixel. [Predefinito: 0.125]

--delta-f-soglia
Soglia facoltativa per terminare l'ottimizzazione (livello) in caso di cambio relativo del target
la funzione scende al di sotto di questo valore. [Predefinito: 0]

AUTORI

Torsten Rohlfing, con contributi di Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Utilizza cmtk-mcwarp online utilizzando i servizi onworks.net