Questo è il comando extractUnmappedSubreads che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
extractUnmappedSubreads.py - Estrai le sottoletture non mappate da un file fasta
DESCRIZIONE
utilizzo: extractUnmappedSubreads.py [-h] [--verbose] [--version] [--profile]
[--debug]
fasta cmp.h5 [cmp.h5 ...]
Estrai le sottoletture non mappate da un file fasta.
posizionale argomenti:
fasta un file fasta contenente tutti i subread.
cmp.h5 immette i file cmp.h5.
opzionale argomenti:
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
--verboso, -v
Imposta il livello di verbosità (predefinito: Nessuno)
--versione
mostra il numero di versione del programma ed esci
--profilo
Stampa profilo runtime all'uscita (impostazione predefinita: False)
- debug
Cattura le eccezioni nel debugger (richiede ipdb) (predefinito: False)
Usa extractUnmappedSubreads online usando i servizi onworks.net