Questa è l'app Linux denominata BIGSdb la cui ultima versione può essere scaricata come bigsdb_1.24.1.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata BIGSdb con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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BIGdb
DESCRIZIONE
Il Bacterial Isolate Genome Sequence Database (BIGSdb) è un sistema di database scalabile e accessibile dal web progettato per archiviare e analizzare le informazioni fenotipiche e genotipiche collegate in modo computazionalmente efficiente. I dati di sequenza possono variare da letture di singole sequenze a più contig generati da tecnologie di sequenziamento dell'intero genoma. Il sistema incorpora la capacità di definire e identificare qualsiasi numero di loci e varianti genetiche in quei loci all'interno delle sequenze nucleotidiche memorizzate. Questi loci possono essere ulteriormente organizzati in schemi per la caratterizzazione isolata o per analisi evolutive o funzionali.Vedi Jolley e Maiden 2010, BMC Bioinformatics 11:595 (http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/595).
Puoi segnalare bug o effettuare richieste di miglioramento utilizzando il tracker dei problemi su https://github.com/kjolley/BIGSdb. Anche il codice sorgente è rispecchiato lì.
Pubblico
Scienza/ricerca, utenti finali avanzati, sviluppatori
Interfaccia utente
Web based-
Linguaggio di programmazione
Perla, JavaScript
Ambiente database
PostgreSQL (pgsql)
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/bigsdb/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
