Questa è l'app Linux denominata MAGeCK per l'esecuzione in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come mageck-0.5.9.3.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata MAGeCK per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
Ad
MAGeCK per funzionare in Linux online
DESCRIZIONE
L'analisi basata sul modello di CRISPR-Cas9 Knockout (MAGeCK) a livello di genoma è uno strumento computazionale per identificare i geni importanti dalla recente tecnologia di screening knockout CRISPR-Cas9 su scala genomica.Per istruzioni e documentazione, fare riferimento alla pagina wiki.
MAGeCK è sviluppato da Wei Li e Han Xu dal laboratorio della dott.ssa Xiaole Shirley Liu presso il Dana-Farber Cancer Institute/Harvard School of Public Health, ed è gestito dal laboratorio Wei Li presso il Children's National Medical Center. Ringraziamo il supporto di Claudia Adams Barr Program in Innovative Basic Cancer Research e NIH/NHGRI per sviluppare MAGeCK.
Caratteristiche
- L'algoritmo di calcolo più popolare nell'analisi di screening
- Oltre 400 citazioni e 60k download
- Pipeline semplice e facile da usare per lo screening dei geni negli esperimenti di Knockout CRISPR-Cas9 a livello di genoma
- Una documentazione completa con tutorial facili da avviare
- Alta sensibilità e basso tasso di falsi rilevamenti
- Mantenimento attivo del codice sorgente con nuove funzionalità e correzioni di bug
- Supporto dalla comunità di sviluppatori e utenti
- Un insieme di funzionalità di visualizzazione che generano cifre standard di pubblicazione
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
pitone, do
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/mageck/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
