Questa è l'app Linux denominata PRIMUS per l'esecuzione in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata PRIMUS per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
PRIMUS per funzionare in Linux online
DESCRIZIONE:
NOVITÀ: scarica la nuova versione con Pedigree Reconstruction su primus.gs.washington.eduQuesta versione è obsoleta e incompleta. Si prega di visitare il nuovo sito web per la versione completa di PRIMUS.
Presentiamo un metodo adattato dalla teoria dei grafi che identifica sempre l'insieme massimo di individui non correlati in qualsiasi set di dati e consente l'utilizzo di parametri di ponderazione nella selezione di campioni non correlati. PRIMUS legge le stime IBD generate dall'utente ed emette il massimo insieme possibile di individui non imparentati, data una soglia specificata di parentela. Possono essere utilizzate anche informazioni aggiuntive per la selezione preferenziale delle persone. Ad esempio, quando in una rete sono presenti due insiemi massimi di uguali dimensioni di individui non imparentati, PRIMUS può selezionare preferenzialmente l'insieme con più individui affetti.
Iscriviti alla lista di posta elettronica PRIMUS-Users per le notifiche di aggiornamenti e nuove versioni.
Software pertinente:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Caratteristiche
- Identifica il numero massimo di individui non correlati da un set di dati genetici
- Raggruppa i campioni in reti familiari
- Genera file .dot per visualizzare le reti familiari
Pubblico
Industria sanitaria, Scienza/Ricerca, Istruzione
Linguaggio di programmazione
Perl
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.