זוהי הפקודה geneparse-mpi שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
geneparse - חזית מטעין קבצי רצף
סינפסה
geneparse [אפשרויות...] [קלט] [קלט2 ...] #קרא קלט וכתוב ל-stdout
תיאור
קורא קובץ רצף וכותב אותו איפשהו (כברירת מחדל ל-stdout).
ניתן לציין טווח ספציפי בתוך קובץ קלט על ידי קובץ [התחלה, עצירה]. הכיכר
ניתן להחליף סוגריים עבור כל אחד מ-{[()]}, (למשל "genome.fa[3000,4000]" או
"genome.fa{3000~4000}"). שים לב שכל אלה עשויים להיות מנותחים על ידי המעטפת שלך. גַם
ניתן להשתמש בכל תו שאינו מילה כדי להפריד בין המספרים.
אפשרויות
--repeatmask|-r
השתמש ברצפים רכים-חוזרים על המסכות (כלומר: החלף בסיסים קטנים ב-N).
--upper|--unmask|-U
באותיות רישיות בכל הבסיסים.
--אורך|-ל
פשוט הדפס את האורך וצא
--נקה|-ג
אל תוסיף שורה חדשה בסיום
--גרסה|-V
מדפיס את גרסת התוכנית
--עזרה|-ח
מדפיס הודעת עזרה
--פלט|-o
שלח פלט לקובץ (אחרת השתמש ב-stdout). --פלט מרמז על --נקה.
--שקט|-ש
להשתיק את כל האזהרות
--verbose|-v
מדפיס הרבה פרטים נוספים
השתמש ב-geneparse-mpi באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net