זוהי הפקודה STAR שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
STAR - מיישר אוניברסלי RNA-seq מהיר במיוחד
תיאור
תוכנת תמלילים משולבים יישור להפניה (STAR) המבוססת על תוכנה קודמת
אלגוריתם יישור RNA-seq לא מתואר שמשתמש בחיפוש זרעים רציף מרבי הניתן למיפוי
במערכי סיומת לא דחוסים ואחריהם הליך קיבוץ זרעים ותפירה. כוכב
עולה על ביצועי מיישרים אחרים בפקטור של >50 במהירות המיפוי, תוך יישור לאדם
גנום 550 מיליון 2 × 76 bp קריאות קצה זוגיות לשעה בשרת צנוע בן 12 ליבות, בעוד
במקביל לשיפור הרגישות והדיוק של היישור. בנוסף לדה חסר פניות
זיהוי נובו של צמתים קנוניים, STAR יכול לגלות חיבורים לא קנוניים ו
תעתיקים כימריים (היתוך), והוא מסוגל גם למפות רצפי RNA באורך מלא.
שימוש ברצף Roche 454 של אמפליקונים של תגובת שרשרת פולימראז בשעתוק הפוך,
המחברים אימתו באופן ניסיוני את צמתי החבור הבין-גניים החדשים משנת 1960 עם 80-90%
אחוזי הצלחה, המאששים את הדיוק הגבוה של אסטרטגיית המיפוי STAR.
תַקצִיר
כוכב --אפשרות 1-שם option1-value(s)--option2-name אפשרות 2-ערך(ים) ...
השתמש ב-STAR מקוון באמצעות שירותי onworks.net