זוהי אפליקציית לינוקס בשם SASHIMI שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור TPP_Setup_6.3.3.exe. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם SASHIMI עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
צילומי מסך:
סשימי
תיאור:
פרויקט Sashimi מארח את ה-Trans-Proteomic Pipeline (TPP), חבילה בוגרת של כלים עבור פרוטאומיקה מבוססת מפרט מסה (MS, MS/MS): אימות סטטיסטי, כימות, הדמיה וממירים מנתוני MS גולמיים ל-mzML/ פורמטים של mzXML.
תכונות
- מנועי חיפוש של מסד נתונים (שביט וכו')
- SpecraST (מנוע חיפוש ספריית ספקטרום)
- חיפוש המוני (מגנום וכו')
- Kojak (חיפוש צולב קישור)
- ניתוח DDA
- DISCo (ניתוח DIA)
- reSpect (ניתוח ספקטרום כימרי)
- כמות MS1 ו-MS2 מסומנת ולא מסומנת
- Decoy Database Generation
- PeptideProphet (אימות רמת PSM)
- iProphet (אימות רמת פפטיד)
- PTMProphet (אימות שינוי לאחר תרגום)
- אימות רמת חלבון
- דור ספריית ספקטרום
- כלים להדמיית נתונים
- קטלוג וחיזוי זמן שמירה
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
מבוסס אינטרנט, שורת פקודה
שפת תכנות
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/sashimi/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.