זוהי אפליקציית Windows בשם kallisto אשר את המהדורה האחרונה שלה ניתן להוריד בשם kallisto_windows-v0.50.0.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם kallisto עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
צילומי מסך:
kallisto
תיאור:
kallisto היא תוכנית לכימות כמעט אופטימלית של שפע תמלול מנתוני RNA-Seq, או באופן כללי יותר של רצפי יעד באמצעות קריאות רצף בתפוקה גבוהה. הוא מבוסס על הרעיון של שימוש בפסאודו-יישור כדי לקבוע במהירות קריאות ותאימות של יעדים, ללא צורך ביישור.
לפי מדדים שנעשו במחשב שולחני של Mac, kallisto יכול לכמת 30 מיליון קריאות RNA-seq אנושיות בתפזורת בפחות מ-3 דקות רק עם רצפי הקריאה ואינדקס התעתיק, שבעצמו יכול להימשך יותר מ-10 דקות לבנות. ומכיוון שהוא משתמש ב-pseudoalignment, הוא עמיד בפני שגיאות בקריאות ומשמר את המידע המרכזי הדרוש לכימות. זה הופך את kallisto לא רק למהיר אלא גם מדויק מאוד. במדדים רבים, הוא אפילו עולה בהרבה על כלים קיימים.
תכונות
- משתמש בהתאמת פסאודו
- מהיר ומדויק
- ניתן לנתח RNA-Seq בתפזורת כמותית בעזרת בדיקה
- ניתן להשתמש עם שרפרפים כדי לעבד מראש נתוני RNA-seq של תא בודד
שפת תכנות
C
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.