これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows Online エミュレーター、MAC OS Online エミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks 無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンド cmtk-glm です。
プログラム：
NAME
glm - 一般線形モデル
SYNOPSIS
glm [オプション] ctlfile imgfile_pattern [ctlfile imgfile_pattern ...]
DESCRIPTION
一般線形モデルを使用した複数の画像のピクセル強度の統計モデリング。
モデルの独立変数は、1つ以上の制御ファイルで定義されます。各
制御ファイルは、独立変数ごとに空白で区切られた 1 つの列を持つテキスト ファイルです。
制御ファイルの最初の行は変数名、つまりラベルを定義します。
各変数を識別します。次の各行には、独立変数ごとに 1 つの値が含まれます。
例：
ID 年齢 性別
01 20 0
02 30 1
各制御ファイル名の後にファイル名パターンが続きます。そのパターンでは、単一の「%s」
プレースホルダーは、各制御ファイル行の最初の列にある値に置き換えられます。
結果の文字列は、読み取られた画像のパスであり、モデル変数に関連付けられている。
特定の制御ファイル行にリストされます。
上記の制御ファイルの例を使用すると、パターン「images/subject%s.nii」は次のように展開されます。
画像ファイル名は「images/subject01.nii」と「images/subject02.nii」です。
それぞれ異なるイメージ ファイル パターンを持つ複数の制御ファイルを使用できます。
OPTIONS
Global BHツールキット オプション （これら shared by を CMTK ツール)
- 助けて
基本的なコマンドラインオプションのリストを標準出力に書き込みます。
--ヘルプ-オール
基本および高度なコマンドラインオプションの完全なリストを標準出力に書き込みます。
--ウィキ
コマンドラインオプションのリストをMediaWikiマークアップの標準出力に書き込みます。
- 男
マニュアルページのソースを「nroff」マークアップで標準出力に書き込みます。
- バージョン
ツールキットのバージョンを標準出力に書き込みます。
- エコー
現在のコマンドラインを標準出力に書き込みます。
--詳細レベル
詳細レベルを設定します。
-詳細, -v
詳細レベルを1増やします（非推奨。下位互換性のためにサポートされています）。
-スレッド
並列スレッドの最大数を設定します（POSIXスレッドおよびOpenMPの場合）。
入力 設定
- 作物 , -c
スペースと時間を節約するには、画像をトリミングします: x0、y0、z0、x1、y1、z2
モデル 設定
- ノーマライズ, -n
データの分散に関してモデル パラメータを正規化します。
--exp, -e
線形モデルではなく指数モデルを使用します。
選択 of 独立した 変数
--exclude-定数, -x
モデルから自動定数パラメータを除外します。
--パラメータを無視 , -i
指定された NUMBER (0..n-1) のパラメータを無視します。繰り返し可能です。
--パラメータを選択 , -s
モデルに指定された名前のパラメータを選択します。繰り返し可能です。
出力 設定
--出力パターン , -O
出力用のファイル名パターン。
%s はイメージタイプ ('fstat'、'tstat'、または 'param') に置き換えられます
%d は独立変数番号に置き換えられます (モデル全体では 0)
%s は独立変数名に置き換えられます (モデル全体の場合は 'model')
[ディフォルト： モデル_%s_%02d_%s.nii ]
作者
Torsten Rohlfing、Michael P. Hasak、Greg Jefferis、CalvinRからの寄稿。
Maurer、Daniel B. Russakoff、およびYaroslav Halchenko
onworks.net サービスを使用して cmtk-glm をオンラインで使用する