hmm2fetch - クラウド上のオンライン

これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MAC OSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドhmm2fetchです。

プログラム:

NAME


hmm2fetch - HMM データベースから HMM を取得する

SYNOPSIS


うーん2fetch [オプション] データベース

DESCRIPTION


うーん2fetch と呼ばれるHMMを取得する小さなユーティリティです。 HMMERモデルデータベースから
呼ばれます データベース。 新しい形式でモデルを作成し、そのモデルを標準出力に出力します。たとえば、
うーん2fetch パム rrm PfamからRRM(RNA認識モチーフ)モデルを取得します。
環境変数HMMERDBはPfamデータベースの場所に設定されます。取得された
HMM ファイルは HMMER 2 ASCII 形式で書き込まれます。

データベースにはGSIインデックスファイルが関連付けられている必要があります。HMMデータベースをインデックスするには、
プログラム hmm2インデックス。

OPTIONS


-h 簡単なヘルプを印刷します。 バージョン番号とすべてのオプションの概要が含まれます。
エキスパートのオプション。

-n 解釈する 名前の代わりにHMM番号として表示されます。番号は0から始まります。
例えば、HMMデータベースから最初のHMMを取得するには、 ふー、 あなたがするだろう
うーん2fetch -n 0 foo。

onworks.net サービスを使用して hmm2fetch をオンラインで使用する



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