これはコマンドmapMers-depthであり、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できます。
プログラム：
NAME
mapMers-depth-kmersをシーケンスにマッピングすることに関する情報を報告します
SYNOPSIS
mapMers-深さ {-カウント|- 深さ|-統計} -マーズ メリル -m メルサイズ -seq インファスタ
OPTIONS
モード of 操作
シーケンス序数 's'およびそのシーケンス内の位置 'p'の場合：
-カウント 位置（p）から始まる単一のkmerのカウント（c）を報告します。
フォーマット： 'spc'
- 深さ 位置（p）にまたがるkmerの数（n）を報告します。
フォーマット： 'spn'
-統計 スパンするすべてのmerの最小（m）、最大（M）、および平均（a）カウントを報告します
位置（p）。 総数（t）とkmerの数（n）も報告します
フォーマット： 'spm M atn'
全般
-m メルサイズ
-マーズ メリル
メリル（1）データベース
-seq インファスタ
fasta入力シーケンス
mapMersを使用する-onworks.netサービスを使用してオンラインで深さ