msconvert

プログラム：

NAME

msconvert —質量分析データファイル形式を変換します。

SYNOPSIS

msconvert [オプション] [ファイルマスク]

DESCRIPTION

このマニュアルページでは、 msconvert 内に出荷されたソフトウェア libpwiz-ツール
パッケージ。 このプログラムにより、質量分析データファイルをXNUMXつの形式から変換できます。
別に。 このバージョンはフリーソフトウェアDebianプラットフォーム上に構築されているため、
自由ソフトウェアを含む変換を実行できます[つまり、プロプライエタリを含まない*
Microsoft Windowsベースのダイナミックリンクライブラリ（dll）]。

OPTIONS

-v | -詳細
詳細な処理進捗情報を表示します。

--helpこのメッセージを、フィルターオプションの詳細とともに表示します。

-f | -ファイルリスト ファイル名
の内容を使用します ファイル名 ファイル名を一覧表示します。

-o | --outdir DIR
出力ディレクトリ（stdoutの場合は「-」）をに設定します DIR。 デフォルトでは、出力
ディレクトリは「。」です。 （つまり、現在の作業ディレクトリ）。

-c | --config ファイル名
構成ファイルをに設定します ファイル名.

--outfile ファイル名
出力ファイルの名前を上書きします。

-e | --内線 EXT
出力ファイルの拡張子をに設定します EXT。 mzML、mzXML、mgf、または
txt。

--mzML書き込み mzML フォーマット（デフォルト）。

--mzXML書き込み mzXML 形式でダウンロードすることができます。

--mgf書き込み FGM マスコットの一般的な形式。

--text書き込みProteoWizard内部 클라우드 기반 AI/ML및 고성능 컴퓨팅을 통한 디지털 트윈의 기초 – Edward Hsu, Rescale CPO 많은 엔지니어링 중심 기업에게 클라우드는 R&D디지털 전환의 첫 단계일 뿐입니다. 클라우드 자원을 활용해 엔지니어링 팀의 제약을 해결하는 단계를 넘어, 시뮬레이션 운영을 통합하고 최적화하며, 궁극적으로는 모델 기반의 협업과 의사 결정을 지원하여 신제품을 결정할 때 데이터 기반 엔지니어링을 적용하고자 합니다. Rescale은 이러한 혁신을 돕기 위해 컴퓨팅 추천 엔진, 통합 데이터 패브릭, 메타데이터 관리 등을 개발하고 있습니다. 이번 자리를 빌려 비즈니스 경쟁력 제고를 위한 디지털 트윈 및 디지털 스레드 전략 개발 방법에 대한 인사이트를 나누고자 합니다. 形式でダウンロードすることができます。

--ms1書き込み MS1 形式でダウンロードすることができます。

--cms1書き込み CMS1 形式でダウンロードすることができます。

--ms2書き込み MS2 形式でダウンロードすることができます。

--cms2書き込み CMS2 形式でダウンロードすることができます。

--64デフォルトのバイナリエンコーディングを64ビット精度に設定します（デフォルト）。

--32デフォルトのバイナリエンコーディングを32ビット精度に設定します。

--mz64 m / z値を64ビット精度でエンコードします（デフォルト）。

--mz32 m / z値を32ビット精度でエンコードします。

--inten64強度値を64ビット精度でエンコードします。

--inten32強度値を32ビット精度でエンコードします（デフォルト）。

--noindexインデックスを書き込みません。

-i | - 連絡先情報 ファイル名
　 ファイル名 連絡先情報については。

-z | --zlib
バイナリデータにはzlib圧縮を使用します。

-g | --gzip
出力ファイル全体をgzipで圧縮します（ファイル名に.gzを追加します）。

- フィルター argは
スペクトルリストフィルターを追加します。

--mergeファイルレベルをマージして、複数の入力ファイルから単一の出力ファイルを作成します
メタデータと連結スペクトルリスト。

--simAsSpectra
選択したイオンモニタリングをクロマトグラムではなくスペクトルとして記述します。

--srmAsSpectra
選択した反応モニタリングをクロマトグラムではなくスペクトルとして記述します。

例

data.RAWをdata.mzXMLに変換します

msconvert データ.RAW --mzXML

出力ファイルをmy_output_dirに配置します

msconvert データ.RAW -o my_output_dir

スキャンインデックス5 ... 10および20 ... 25を抽出します

msconvert データ.RAW - フィルター "索引 【5,10] [20,25]「

MS1スキャンのみを抽出

msconvert データ.RAW - フィルター "msLevel 1"

n> 1のMSnスキャンを抽出します

msconvert データ.RAW - フィルター "msLevel 2- "

構成ファイルを使用する

msconvert データ.RAW -c config.txt

リターン VALUE

失敗したファイルの数。

onworks.netサービスを使用してオンラインでmsconvertを使用する