これは、Linux でオンラインで実行するための HMCan という名前の Linux アプリで、最新リリースは HMCan.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
HMCan という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
HMCan は Linux 上でオンラインで実行可能
説明：
HMCan は、がん ChIP-seq データのヒストン修飾を検出するために開発された隠れマルコフ モデル ベースのツールです。 コピー数補正、GC バイアス補正、ノイズ レベル補正の XNUMX つの補正ステップをデータに適用します。HMCan を実行するには、ChIP-seq ターゲット アライメント ファイルとコントロール アライメント ファイルが必要です。 いくつかの設定も必要です。詳細については、README ファイルを確認してください。
著者: ハイサム・アショア
連絡先: Valentina Boeva Institute Curie
ハイサム・アショア・キング・アブドラ科学技術大学。
プログラミング言語
C + +
これは、https://sourceforge.net/projects/hmcan/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。