これは、Linux オンラインで実行する PRIMUS という名前の Linux アプリで、最新リリースは URLtoLastestPRIMUSversion.txt としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
PRIMUS という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
PRIMUS をオンラインの Linux で実行
説明：
新規: 血統再構築を含む新しいバージョンを primus.gs.washington.edu でダウンロードします。このバージョンは古くて不完全です。 PRIMUS の完全版については、新しい Web サイトをご覧ください。
我々は、あらゆるデータセット内の無関係な個人の最大セットを常に特定し、無関係なサンプルの選択に重み付けパラメータを利用できるようにする、グラフ理論を応用した方法を提案します。 PRIMUS は、ユーザーが生成した IBD 推定値を読み取り、指定された関連性のしきい値を考慮して、無関係な個人の可能な最大のセットを出力します。 個人を優先的に選択するための追加情報も利用することができる。 たとえば、ネットワーク内に無関係な個人の等しいサイズの最大セットが XNUMX つある場合、PRIMUS はより影響を受ける個人が含まれるセットを優先的に選択できます。
PRIMUS-Users の電子メール リストに登録して、更新と新しいバージョンの通知を受け取ります。
関連ソフトウェア:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
特徴
- 遺伝的データセットから無関係な個人の最大セットを特定します
- サンプルを家族ネットワークにグループ化します
- 家族ネットワークを視覚化するための .dot ファイルを生成します
Audience
ヘルスケア産業、科学/研究、教育
プログラミング言語
パール
これは、https://sourceforge.net/projects/primus-beta/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。