これは、Linux経由でWindowsで実行できるREDOというWindowsアプリです。最新リリースはREDO.tar.gzとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
REDO というこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux 経由で Windows で無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
スクリーンショットは
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REDO は Linux オンラインで Windows オンラインで実行できます
DESCRIPTION
REDOは、バリアントコール結果（VCFファイル）に基づいてオルガネラ内のRNA編集イベントを特定するための包括的なアプリケーションツールです。Perlスクリプトスイートであり、PerlおよびR環境がインストールされているあらゆるオペレーティングシステムで簡単に直接操作できます。REDOでは、厳格なルール依存フィルターと統計フィルターが使用され、偽陽性率を低減しています。RNA編集部位の詳細なアノテーション、統計情報、および図表を提供できます。REDOは、複数のサンプルで同時にRNA編集イベントを検出し、異なるサンプルにおけるRNA編集イベントの割合の違いを特定することもできます。さらに、ゲノム変異は、パッケージに含まれるサブプログラムfish.plによって簡単に除去できます。オプション
- 誤検知はルール依存フィルタと統計フィルタによってフィルタリングされます
- 遺伝子名、遺伝子内のヌクレオチドとアミノ酸の位置、コドンフェーズ、参照および編集対立遺伝子、参照および編集コドン、参照および編集アミノ酸、編集割合、遺伝子機能などを含む詳細な注釈が提供されます。
- REDO では、RNA 編集タイプ、疎水性/親水性変更、サイレント/非サイレント変更、編集部位のコドン フェーズなどの便利な統計も提供されます。
- RNA 編集部位の属性を説明するために、サンプルごとに R プログラムを使用して 16 個の図が作成されます。
- REDO は、複数のサンプル内の RNA 編集イベントを同時に検出できます。
- 複数のサンプルにおける RNA 編集イベントの異なる割合を識別できます。
- サブプログラムを使用すると、REDO 結果テーブルを簡単かつ迅速に処理できます。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
パール
このアプリケーションは、https://sourceforge.net/projects/redo/ からも入手できます。OnWorks でホストされているため、無料のオペレーティングシステムから最も簡単にオンラインで実行できます。
