이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 명령 ipig입니다.
프로그램:
이름
ipig - PSM을 게놈 브라우저 시각화에 통합
개요
아이피그 <psm 파일> |-g|-c|-cg [ ]
기술
iPiG는 질량 분석에서 PSM(펩티드 스펙트럼 일치)의 통합을 목표로 합니다.
(MS) 게놈 브라우저에 의해 제공되는 게놈 시각화에 대한 펩타이드 식별
UCSC 게놈 브라우저(http://genome.ucsc.edu/).
iPiG는 MS 표준 형식 mzIdentML(*.mzid) 또는 텍스트 형식에서 PSM을 가져오고
게놈 트랙 형식(BED 및 GFF3 파일)으로 결과 제공
게놈 브라우저로 가져옵니다.
옵션
<psm 파일>
펩타이드 스펙트럼이 일치하는 파일을 나타냅니다(mzid/txt).
-g, -gui
iPiG의 그래픽 사용자 인터페이스를 시작합니다.
-c, -제어
유전자 제어를 시작합니다. 필요한 파일은 구성에 표시되어야 합니다.
파일
-CG, -제어기
유전자 제어의 그래픽 사용자 인터페이스를 시작합니다.
-d, -다운로더
다운로드 GUI 시작
다른 구성 파일이 표시될 수 있습니다(그렇지 않으면 ipig.conf가 로드됩니다.
기본)
추가 요구 사항:
비 GUI 모드를 사용하는 경우 구성 파일(기본적으로 ipig.conf)에는 여러
추가 매개변수(예: 참조 게놈 표시 등)
GUI 모드(-g 및 -CG), 추가 매개변수는 두 가지 방법으로 표시될 수 있습니다.
인터페이스 또는 구성 파일로도 가능합니다.
예제와 자세한 내용은 readme.txt 및 ipig.conf를 살펴보십시오.
추가 매개 변수
onworks.net 서비스를 사용하여 ipig 온라인 사용