Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 tcodee 명령입니다.
프로그램:
이름
tcode - Fickett TESTCODE 통계를 사용하여 단백질 코딩 영역 식별
개요
티코드 -순서 시퀄 -데이터 파일 데이터 파일 -창문 정수 단계 정수 -구성 비녀장
-아웃파일 신고 -그래프 xygraph
티코드 -도움
기술
티코드 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈 소프트웨어
모음곡"). 이는 "핵:유전자 발견" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
-순서 시퀄
-데이터 파일 데이터 파일
기본 데이터 파일은 Etcode.dat이며 각 염기에 대한 코딩 확률을 포함합니다.
확률은 위치 정보와 구성 정보 모두에 대한 것입니다. 기본
값: Etcode.dat
필수 섹션에 있어야 합니다.
-창문 정수
이것은 TESTCODE 통계가 될 뉴클레오티드 염기의 수입니다.
매번 수행. 그런 다음 창은 시퀀스를 따라 슬라이드되어 동일한 내용을 덮습니다.
매번 염기 수. 기본값: 200
Advnaced 섹션에 있어야 합니다.
단계 정수
선택한 창은 기본적으로 뉴클레오티드 서열을 따라 XNUMX개씩 슬라이드됩니다.
한 번에 기본을 유지하면서 프레임을 유지합니다(알고리즘은 프레임에 민감하지 않지만).
이는 슬라이드의 증분을 늘리거나 줄이기 위해 변경될 수 있습니다. 기본값:
3
산출 섹션에 있어야 합니다.
-구성 비녀장
선택 시 코딩 점수(Y)에 대해 플롯된 시퀀스(X 축) 그래프
축)이 표시됩니다. 녹색 선 위의 순서는 코딩, 빨간색 아래의 순서는 코딩입니다.
라인은 비코딩입니다. 기본값: N
-아웃파일 신고
-그래프 xygraph
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 tcodee를 사용하세요.
