엑스크리스덴

프로그램:

이름

xcrysden - 결정 및 분자 구조 시각화 도구

개요

엑스크리스덴 [특수 옵션]
엑스크리스덴 [특수 옵션] 형식 옵션 파일|예배 규칙서

기술

XCrySDen 를 목표로 하는 결정질 및 분자 구조 시각화 프로그램입니다.
결정 구조에 중첩될 수 있는 등고선 및 등고선 표시
대화식으로 회전하고 조작합니다.

스페셜 옵션

-h
--도움
도움말 메시지를 표시합니다.

-v
--번역
프로그램 버전 정보를 표시합니다.

-u id
--사용하다 id
window-ID=를 사용하여 컨테이너 창에 포함된 XCrySDen 로드id.

-r 어둑한
--감소 어둑한
XSF 파일의 주기적인 차원을 다음으로 줄입니다. 어둑한. 전에 지정해야 합니다. --xsf 선택권,
예를 들어, 엑스크리스덴 -r 2 --xsf 파일.

-c 파일
--커스텀 파일
지정된 파일에서 사용자 정의 정의를 로드합니다(구문은 다음과 같습니다.
~/.xcrysden/사용자 정의 정의).

-a 파일
--속성 파일
파일에서 속성을 로드합니다. 속성 파일의 형식은 다음과 같습니다.

요소 색상
원자 번호 1 red1 blue1 green1
원자 번호 2 red2 blue2 green2
...
엘레멘트라디우스
원자 번호 1 반경1
원자 번호 2 반경2
...

-l 파일
--빛 파일
XCrySDen의 조명 형식 파일에서 조명 매개변수를 로드합니다.

FORMAT 옵션

--xsf 파일
XCrySDen의 구조 파일(XSF) 형식 파일에서 구조를 로드합니다.

--animxsf 파일
--axsf 파일
Animated-XCrySDen's-Structure-File(AXSF) 형식 파일에서 구조체를 로드합니다.

--bxsf 파일
BXSF(Band-XSF) 파일에서 밴드를 로드하고 페르미 표면을 시각화합니다.

--xmol 파일
--xyz 파일
XYZ 형식의 파일에서 구조를 로드합니다.

--pdb 파일
PDB 형식의 파일에서 구조를 로드합니다.

--gzmat 파일
Gaussian Z-matrix에서 구조를 로드합니다(Open-Babel 프로그램 필요).

--gaussian_out 파일
--gxx_out 파일
--g98_out 파일
가우스 출력 파일에서 구조를 로드합니다. 단일 포인트 계산 및
최적화 실행은 지금까지 지원됩니다. 최적화 실행을 위해 다음을 수행할 수 있습니다.
실행 중에 생성된 모든 구조를 렌더링합니다.

--입방체 파일
--gXX_큐브 파일
--g98_cube 파일
가우스 큐브 파일에서 구조를 로드합니다. 큐브 파일은 다음과 같이 생성되어야 합니다.
Cube=카드 옵션. 스칼라 큐브 파일, 즉 Cube=(Cards,Density)만 지원됩니다.
또는 Cube=(Cards,Orbitals) 또는 Cube=(Cards,Potential). GAUSSIAN 설명서를 참조하십시오.
이 키워드의 의미.

--crystal_inp 파일
CRYSTAL(http://http//www.crystal.unito.it/) 입력 파일.

--crystal_f9 파일
CRYSTAL(http://http//www.crystal.unito.it/) 포트란 단위 9.

--wien_struct 파일 헤드|파일|예배 규칙서
WIEN2k(http://www.wien2k.at/) 구조체 파일, 여기서:

파일 헤드 = 없는 구조체 파일의 이름 .구조체 신장,
파일 = 파일 이름,
예배 규칙서 = 케이스 디렉토리의 이름.

--wien_kpath 예배 규칙서|구조체 파일
읽기 구조체 파일을 만들고 특별한 k-포인트가 있는 첫 번째 Brillouin 영역을 렌더링합니다. K-경로는
특수 k-포인트를 마우스로 클릭하여 대화식으로 선택합니다. 사용자가 지정해야 합니다. 에민
그리고 EMAX 에너지와 경로를 따라 있는 k-포인트의 총 수. 이 수치는 단순히
XCrySDen은 매우 균일하게 하려고 하므로 총 k-포인트 수 추정
경로를 따라 k 포인트 샘플링(WIEN2k 최대 허용 k 수를 지정하지 마십시오.
XCrySDen이 몇 점을 더 생성할 수 있기 때문입니다.

--wien_renderdensity 예배 규칙서
읽기 구조체, 출력및 rho 파일 및 렌더링 결정 구조 및 사전 계산
전하 밀도.

--wien_밀도 디렉토리
전하 밀도 계산을 위한 2D 또는 3D 영역은 다음과 같이 대화식으로 선택됩니다.
마우스 클릭. XCrySDen 생성 in5 파일(들), 전하 밀도 계산 및 렌더링
isolines/colorplanes(2D) 또는 isosurfaces(3D).

--wien_fermi표면 예배 규칙서
Fermi 표면 생성을 위한 팝업 작업 창. 몇 단계 후에 페르미
surface는 3D isosurface로 그려집니다.

--fhi_inpini 파일
FHI98MD의 하중 구조 inp.ini 포맷된 파일.

--fhi_coord 파일
FHI98MD의 하중 구조 코디 아웃 포맷된 파일.

--pwi
--pw_inp 파일
에서 구조 로드 pw.x 입력 파일. pw.x 의 유사전위 평면파 프로그램입니다.
Quantum-ESPRESSO 배포(http://www.quantum-espresso.org/).

--pwo
--pw_out 파일
에서 구조 로드 pw.x 출력 파일. pw.x 의 유사전위 평면파 프로그램입니다.
Quantum-ESPRESSO 배포(http://www.quantum-espresso.org/).

-s 스크립트
--스크립트 스크립트
Tcl 스크립트가 포함된 파일에서 스크립트를 로드합니다.

onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 xcrysden 사용