이것은 FamSeq1.0.2.tar.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 FamSeq라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
무료로 OnWorks와 함께 Linux에서 실행하려면 FamSeq라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
FamSeq, Linux 온라인에서 실행
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기술
희귀 변종을 호출하는 것은 여전히 어려운 일입니다. 가족 기반 시퀀싱 연구에서 모든 가족 구성원의 정보를 활용하여 새로운 생식선 돌연변이를 보다 정확하게 식별해야 합니다. FamSeq는 가족 전체의 원시 측정값을 감안할 때 개인이 변이를 보유할 확률을 제공함으로써 이러한 목적을 달성합니다. FamSeq는 새로운 돌연변이를 수용하고 염색체 X에서 변이 호출을 수행할 수 있습니다.데이터 복잡성의 변화를 수용하기 위해 FamSeq는 멘델식 유전 모델의 세 가지 고유한 구현인 베이지안 네트워크 알고리즘, 엘스톤-스튜어트 알고리즘 및 마르코프 체인 몬테카를로 알고리즘으로 구성됩니다. 소프트웨어를 효율적이고 대가족에 적용할 수 있도록 NVIDIA® 그래픽 처리 장치에서 계산 정밀도를 잃지 않으면서 근친 교배 루프가 있는 가계도에 대처하는 베이지안 네트워크 알고리즘을 병렬화했습니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
C + +
이것은 https://sourceforge.net/projects/famseq/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
