MAGeCK이라는 이름의 Linux 앱으로, Linux 온라인에서 실행 가능하며 최신 버전은 mageck-0.5.9.3.tar.gz로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
무료로 MAGeCK이라는 앱을 다운로드하여 온라인에서 실행하고, OnWorks와 함께 Linux에서 온라인으로 실행해보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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Linux에서 온라인으로 실행하기 위한 MAGeCK
기술
게놈 전체에 걸친 CRISPR-Cas9 녹아웃(MAGeCK)의 모델 기반 분석은 최근 게놈 규모의 CRISPR-Cas9 녹아웃 스크린 기술에서 중요한 유전자를 식별하기 위한 계산 도구입니다.지침 및 문서는 위키 페이지를 참조하십시오.
MAGECK은 Dana-Farber Cancer Institute/Harvard School of Public Health에 있는 Dr. Xiaole Shirley Liu의 연구실에서 Wei Li와 Han Xu에 의해 개발되었으며 Children's National Medical Center의 Wei Li 연구실에서 유지 관리됩니다. MAGECK을 개발하기 위해 혁신적인 기초 암 연구의 Claudia Adams Barr 프로그램과 NIH/NHGRI의 지원에 감사드립니다.
기능
- 스크리닝 분석에서 가장 널리 사용되는 계산 알고리즘
- 400회 이상 인용 및 60회 다운로드
- 게놈 전체의 CRISPR-Cas9 녹아웃 실험에서 유전자를 스크리닝하기 위한 간단하고 사용하기 쉬운 파이프라인
- 시작하기 쉬운 튜토리얼이 포함된 완전한 문서
- 높은 감도와 낮은 오탐지율
- 새로운 기능 및 버그 수정으로 소스 코드를 적극적으로 유지 관리
- 개발자 및 사용자 커뮤니티의 지원
- 출판 표준 수치를 생성하는 시각화 기능 세트
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
파이썬, C
https://sourceforge.net/projects/mageck/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
