이것은 최신 릴리스를 WindowsRelease.zip으로 다운로드할 수 있는 Molecular Dynamics Studio라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 Molecular Dynamics Studio라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린샷:
분자동역학 스튜디오
설명 :
이것은 분자 역학 세포를 쉽게 생성할 목적으로 NanoEngineer-1, PACKMOL 및 MSI2LMP를 통합하기 위해 생성된 소프트웨어 수정 모음입니다. NanoEngineer-1은 Nanorex가 작성한 분자 CAD 소프트웨어로 사용자에게 분자를 생성하는 쉬운 방법을 제공하며 소프트웨어 수정을 통해 사용자는 여러 힘장을 사용하여 원자를 입력할 수 있습니다. PACKMOL은 NanoEngineer-1의 분자 템플릿을 사용하여 분자의 무작위 컬렉션을 생성하여 초기 MD 셀을 제공할 수 있습니다. PACKMOL을 수정하면 원자 유형 데이터를 MSI2LMP 소프트웨어로 전달할 수 있습니다. MSI2LMP는 클래스 I 또는 클래스 II 포스 필드를 기반으로 LAMMPS 입력 파일을 생성합니다. MSI2LMP는 NanoEngineer-1에 의해 생성된 수치적으로 코딩된 포스 필드 데이터를 사용하도록 수정되었습니다. MMP 파일 형식이 확장되어 세 가지 소프트웨어 응용 프로그램 모두에 통합되었습니다.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
특징
- NanoEngineer-1을 통한 분자 CAD 기능
- CFF91 원자력장을 기반으로 원자를 수동으로 입력
- NanoEngineer-1을 사용하여 분자 템플릿 생성
- PACKMOL 및 다중 분자 템플릿을 사용하여 MD 세포 생성
- MSI2LMP를 사용하여 LAMMPS 지오메트리 입력 파일 생성
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
오픈GL, Qt
프로그래밍 언어
포트란, 파이썬, C++, C
카테고리
이것은 https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 우리의 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.