이것은 SOAPdenovo2라는 이름의 Linux 앱이며 최신 릴리스는 SOAPdenovo2-src-r240.tgz로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 SOAPdenovo2라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
SOAPdenovo2
설명 :
SOAPdenovo2의 다음 단계:
MEGAHIT는 SOAPdenovo2의 정식 후속 제품입니다.
MEGAHIT: 간결한 de Bruijn 그래프를 통한 크고 복잡한 metagenomics 어셈블리를 위한 초고속 단일 노드 솔루션
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
GitHub의 최신 코드:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo는 인간 크기의 게놈을 위한 de novo 드래프트 어셈블리를 구축할 수 있는 새로운 short-read 어셈블리 방법입니다. 이 프로그램은 Illumina 짧은 읽기를 조립하도록 특별히 설계되었습니다. 참조 시퀀스를 구축하고 비용 효율적인 방식으로 미개척 게놈의 정확한 분석을 수행할 수 있는 새로운 기회를 창출합니다. SOAPdenovo2는 SOAPdenovo의 후속 제품입니다. SOAPdenovo2를 인용하려면 GigaScience(아래 웹 사이트 참조)에 게시된 논문을 인용하십시오.
오디언스 (Audience)
과학/연구, 개발자
사용자 인터페이스
명령줄
프로그래밍 언어
C++, 씨
데이터베이스 환경
플랫 파일
이것은 https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.