ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ edialigne ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
edialign - ການຈັດລໍາດັບຫຼາຍທ້ອງຖິ່ນຂອງລໍາດັບ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ດັດປັບ - ລໍາດັບ seqset -nucmode ບັນຊີລາຍຊື່ -revcomp ປຸ້ຍ [- ທັບຊ້ອນກັນ ການຄັດເລືອກ]
[- ການເຊື່ອມຕໍ່ ບັນຊີລາຍຊື່] [-maxfragl integer] - fragmat ປຸ້ຍ -fragsim integer
[- ຄະແນນຂອງມັນ ປຸ້ຍ] [- ເກນ float] -ຫນ້າກາກ ປຸ້ຍ -dostars ປຸ້ຍ
- starnum integer -outfile outfile - outseq ລໍາດັບ
ດັດປັບ -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
ດັດປັບ ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "ຈັດຮຽງ: ຫຼາຍ" .
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqset
ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
-nucmode ບັນຊີລາຍຊື່
ຮູບແບບການຈັດລຽງລໍາດັບອາຊິດ nucleic (ງ່າຍດາຍ, ແປພາສາຫຼືປະສົມ) ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ນ
-revcomp ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
- ທັບຊ້ອນກັນ ການຄັດເລືອກ
ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນການຊ້ອນກັນນ້ຳໜັກຖືກໃຊ້ເມື່ອ Nseq =<35 ແຕ່ທ່ານສາມາດຕັ້ງນີ້ເປັນ 'ແມ່ນ' ຫຼື
'ບໍ່' ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ (ເມື່ອ Nseq =< 35)
- ການເຊື່ອມຕໍ່ ບັນຊີລາຍຊື່
ວິທີການຈັດກຸ່ມເພື່ອສ້າງຕົ້ນໄມ້ລໍາດັບ (UPGMA, ການເຊື່ອມໂຍງຂັ້ນຕ່ໍາຫຼືສູງສຸດ
linkage) ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: UPGMA
-maxfragl integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 40
- fragmat ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
-fragsim integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 4
- ຄະແນນຂອງມັນ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
- ເກນ float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.0
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-ຫນ້າກາກ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
-dostars ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
- starnum integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 4
-outfile outfile
- outseq ລໍາດັບ
ໃຊ້ edialigne ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net