ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ Digital Expression ຢູ່ໃນເວັບເພື່ອໃຊ້ໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ dew_RC2.tar.bz2. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ Digital Expression ໃນເວັບເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
Digital Expression ຢູ່ໃນເວັບເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌
Ad
ລາຍລະອຽດ
DEW ເປັນແພລະຕະຟອມທີ່ອະນຸຍາດໃຫ້ຜູ້ໃຊ້ສາມາດຄົ້ນຫາຂໍ້ມູນ RNA-Seq. ມີສ່ວນຕິດຕໍ່ຜູ້ໃຊ້ແບບກຣາຟິກທີ່ອີງໃສ່ເວັບ.ການວິເຄາະດໍາເນີນການດັ່ງນີ້: ການຈັດຮຽງ gapped ໄດ້ຖືກປະຕິບັດແລະແກ້ໄຂສໍາລັບຄວາມຍາວ, PCR ແລະ fragment bias ດັ່ງນັ້ນ Fragment Per (effective) Kilobase per Million of reads (FPKM) ໄດ້ຖືກຄາດຄະເນເຊັ່ນດຽວກັນກັບການອ່ານທີ່ງ່າຍກວ່າ Per Kb ຕໍ່ລ້ານຂອງການອ່ານ (. RPKM). ເມື່ອສະຫນອງໃຫ້ກັບ isoforms ຫຼາຍແລະໃນໂຫມດ 'contextual', ການແກ້ໄຂປະກອບມີ algorithm maximization ຄວາມຄາດຫວັງທີ່ຄາດຄະເນການສະແດງອອກທີ່ມີປະສິດຕິຜົນແລະການຈັດຕໍາແຫນ່ງທີ່ຖືກຕ້ອງຖືກຜະລິດ. ສໍາລັບແຕ່ລະພັນທຸກໍາທີ່ຜູ້ໃຊ້ໃຫ້, DEW ຄິດໄລ່ສະຖິຕິການອະທິບາຍການຄຸ້ມຄອງ (RPKM, FKMP ແລະຈໍານວນທັງຫມົດ, ຄ່າສະເລ່ຍແລະຄ່າປານກາງ), ໂປຣໄຟລ໌ການສະແດງອອກ (ປົກກະຕິເປັນ R / FPKM ແລະ trimmed mean ຂອງການປ່ຽນແປງເທົ່າ). DEW ອະນຸຍາດໃຫ້ຜູ້ໃຊ້ສາມາດສໍາຫຼວດຂໍ້ມູນໂດຍການສະຫນອງການໂຕ້ຕອບກາຟ.
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ອີງຕາມເວບໄຊທ໌
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl, JavaScript, S/R
ສະພາບແວດລ້ອມຖານຂໍ້ມູນ
SQLite
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/dew/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.
