ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ Meraculous-2D ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌ ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ Meraculous-v2.2.6.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ຊື່ Meraculous-2D ເພື່ອດໍາເນີນການໃນ Linux ອອນໄລນ໌ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ພາບຫນ້າຈໍ:
Meraculous-2D ເພື່ອແລ່ນໃນ Linux ອອນໄລນ໌
DESCRIPTION:
----------------------------------------ສິ່ງສຳຄັນ: Meraculous-2D ໄດ້ຖືກປ່ຽນແທນໂດຍຕົວປະກອບ HipMer. ເອົາມັນຈາກທີ່ນີ້: https://sourceforge.net/projects/hipmer/
-----------------------------------------
Meraculous-2D ເປັນຕົວປະກອບ genome ທັງຫມົດສໍາລັບການອ່ານ NGS (Illumina) ທີ່ສາມາດປະກອບ genomes ຂະຫນາດໃຫຍ່, diploid ກັບຂໍ້ກໍານົດການຄິດໄລ່ເລັກນ້ອຍ. ຄຸນນະສົມບັດປະກອບມີ:
- ປະສິດທິພາບການນັບ k-mer ແລະ deBruijn graph traversal
- ສອງຮູບແບບການຈັດການຂອງການປ່ຽນແປງ allelic diploid
- ປັບປຸງ scaffolding ທີ່ຜະລິດການປະກອບທີ່ສົມບູນຫຼາຍໂດຍບໍ່ມີການປະນີປະນອມຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງ scaffolding.
ການປະກອບແມ່ນຂັບເຄື່ອນໂດຍທໍ່ perl ເຊິ່ງປະຕິບັດການແບ່ງສ່ວນຂໍ້ມູນແລະການດຸ່ນດ່ຽງການໂຫຼດ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບການຍື່ນສະເຫນີແລະການກວດສອບຫຼາຍ arrays ໃນກຸ່ມ GE / SLURM-type ຫຼືເຄື່ອງແມ່ຂ່າຍ multi-core standalone.
ຫນັງສືໃບລານໃນການຍື່ນສະເຫນີ:
https://arxiv.org/abs/1703.09852
https://arxiv.org/abs/1608
ຄຸນລັກສະນະ
- ສະພາແຫ່ງ Genome Eukaryotic
- ໂຫມດພິເສດສໍາລັບ genomembly ສູງແລະຕ່ໍາ heterozygosity
- ການປະຕິບັດການແຈກຢາຍໃນຕົວ
- ການປະຕິບັດພື້ນທີ່ k-mer ທີ່ມີປະສິດທິພາບ
- ເຊີບເວີດຽວ ແລະ ການນຳໃຊ້ທີ່ພ້ອມຂອງກຸ່ມ (AWS-ready)
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Perl, C++
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/meraculous20/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.