ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ MIPGen ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ mipgen_v15.tar.gz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ MIPGen ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ພາບຫນ້າຈໍ:
MIPGen
DESCRIPTION:
ການຜະລິດທີ່ມີທ່າແຮງການໂຕ້ຕອບໂມເລກຸນ
MIPGEN ແມ່ນໂຄງການ python ທີ່ຈະຄິດໄລ່ Molecular Interaction Potential grid
ໃນໄລຍະໂມເລກຸນທີ່ໃຫ້, ນັ້ນອາດຈະເປັນທາດໂປຼຕີນຫຼືສານປະກອບອິນຊີຂະຫນາດນ້ອຍ (ຢາ).
ຜົນໄດ້ຮັບຈະເປັນຊຸດຂອງຕາຂ່າຍໄຟຟ້າທີ່ມີຮູບແບບ DX (*.dx) ທີ່ຜູ້ໃຊ້ຈະສາມາດ
ເພື່ອເບິ່ງພາບໂດຍໃຊ້ໂຄງການສະແດງພາບໂມເລກຸນເຊັ່ນ VMD, PyMol, Chimera ...
ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບການຂຶ້ນກັບ ແລະການນໍາໃຊ້, ກະລຸນາອ່ານເອກະສານ.
ຜູ້ໃຊ້ແມ່ນຍິນດີຕ້ອນຮັບທີ່ຈະຂຽນຂໍ້ຜິດພາດຫຼືການຮ້ອງຂໍພາຍໃຕ້ເມນູ BUGS & REQUESTS. (ບັນຊີ sourceforge ຈະມີຄວາມຈໍາເປັນ).
ຄຸນລັກສະນະ
- ການຜະລິດ MIP ອັດຕະໂນມັດຢ່າງເຕັມສ່ວນໃຫ້ໄຟລ໌ PDB ງ່າຍດາຍ.
- ລະຫັດແຫຼ່ງເປີດ. ຜູ້ໃຊ້ຍິນດີຕ້ອນຮັບການປະກອບສ່ວນຂະຫຍາຍ probes ຫຼືປັບປຸງລະຫັດ.
- ຄິດໄລ່ຕາຂ່າຍໄຟຟ້າການພົວພັນລະຫວ່າງໂມເລກຸນຫຼາຍກວ່າ peptides ແລະລະບົບ macromolecular ອື່ນໆ (ບາງທີຍັງຊ້າສໍາລັບລະບົບຂະຫນາດໃຫຍ່)
- ຄິດໄລ່ MIP ຫຼາຍກວ່າໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍ
- probes ປັບແຕ່ງໄດ້. ປະຕິບັດແລ້ວ: Hydrophobic, H-Bond donor, H-Bond acceptor ແລະ electrostatics probes.
- ການມອບຫມາຍອັດຕະໂນມັດຂອງປະເພດອະຕອມໃຫ້ກັບໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍແລະທາດໂປຼຕີນໂດຍການຕິດຕໍ່ກັບ opensource Antechamber ແລະ tLeap ຈາກຊຸດ AmbertTools (http://ambermd.org)
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ, ຜູ້ໃຊ້ສຸດທ້າຍ, ນັກພັດທະນາ, ຜູ້ໃຊ້ສຸດທ້າຍ/ເດັສທັອບ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
Console/Terminal
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python
ສະພາບແວດລ້ອມຖານຂໍ້ມູນ
SQLite
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/mipgen/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.