ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ SASHIMI ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ເປັນ TPP_Setup_6.3.3.exe. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີບ່ອນເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ SASHIMI ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
ພາບຫນ້າຈໍ:
ຊາຊິມິ
DESCRIPTION:
ໂຄງການ Sashimi ເປັນເຈົ້າພາບໂຄງການ Trans-Proteomic Pipeline (TPP), ຊຸດເຄື່ອງມືທີ່ແກ່ແລ້ວສຳລັບ mass-spec (MS, MS/MS) ໂດຍອີງໃສ່ proteomics: ການກວດສອບສະຖິຕິ, ປະລິມານ, ການເບິ່ງເຫັນ, ແລະຕົວປ່ຽນຈາກຂໍ້ມູນ MS ດິບໄປສູ່ mzML/ ເປີດ. ຮູບແບບ mzXML.
ຄຸນລັກສະນະ
- ຖານຂໍ້ມູນເຄື່ອງຈັກຊອກຫາ (comet ແລະອື່ນໆ)
- SpecraST (Spectrum Library Search Engine)
- ການຊອກຫາມະຫາຊົນ (Magnum ແລະອື່ນໆ)
- Kojak (Crosslinking Search)
- ການວິເຄາະ DDA
- DISCo (ການວິເຄາະ DIA)
- reSpect (ການວິເຄາະ Chimeric Spectrum)
- MS1 ແລະ MS2 Quantitation Labeled ແລະ Unlabelled
- ການສ້າງຖານຂໍ້ມູນ Decoy
- PeptideProphet (ການກວດສອບລະດັບ PSM)
- iProphet (ການກວດສອບລະດັບ Peptide)
- PTMProphet (ການກວດສອບການດັດແກ້ຫຼັງການແປ)
- ການກວດສອບລະດັບທາດໂປຼຕີນ
- ການສ້າງຫໍສະໝຸດ Spectrum
- ເຄື່ອງມືການເບິ່ງເຫັນຂໍ້ມູນ
- ການເກັບຮັກສາ Cataloging ແລະການຄາດຄະເນ
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ອີງໃສ່ເວັບ, ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
ປະເພດ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/sashimi/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ດ້ວຍວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.