ນີ້ແມ່ນແອັບ Linux ທີ່ມີຊື່ວ່າ SOAPdenovo2 ເຊິ່ງລຸ້ນຫຼ້າສຸດສາມາດດາວໂຫຼດໄດ້ໃນນາມ SOAPdenovo2-src-r240.tgz. ມັນສາມາດດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ຢູ່ໃນຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີ OnWorks ສໍາລັບສະຖານີເຮັດວຽກ.
ດາວນ໌ໂຫລດແລະດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ app ນີ້ມີຊື່ SOAPdenovo2 ກັບ OnWorks ໄດ້ຟຣີ.
ປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາເຫຼົ່ານີ້ເພື່ອດໍາເນີນການ app ນີ້:
- 1. ດາວໂຫຼດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກນີ້ໃນ PC ຂອງທ່ານ.
- 2. ໃສ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 3. ອັບໂຫລດແອັບພລິເຄຊັນນີ້ຢູ່ໃນຕົວຈັດການໄຟລ໌ດັ່ງກ່າວ.
- 4. ເລີ່ມ OnWorks Linux ອອນລາຍ ຫຼື Windows online emulator ຫຼື MACOS online emulator ຈາກເວັບໄຊທ໌ນີ້.
- 5. ຈາກ OnWorks Linux OS ທີ່ເຈົ້າຫາກໍ່ເລີ່ມຕົ້ນ, ໄປທີ່ຕົວຈັດການໄຟລ໌ຂອງພວກເຮົາ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ດ້ວຍຊື່ຜູ້ໃຊ້ທີ່ທ່ານຕ້ອງການ.
- 6. ດາວນ໌ໂຫລດຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ, ຕິດຕັ້ງມັນແລະດໍາເນີນການ.
SOAPdenovo2
DESCRIPTION:
ແມ່ນຫຍັງຕໍ່ໄປຂອງ SOAPdenovo2:
MEGAHIT ເປັນຜູ້ສືບທອດຢ່າງເປັນທາງການຂອງ SOAPdenovo2
MEGAHIT: ເປັນໂຊລູຊັ່ນດຽວທີ່ໄວທີ່ສຸດສໍາລັບການປະກອບ metaagenomics ຂະຫນາດໃຫຍ່ແລະສະລັບສັບຊ້ອນໂດຍຜ່ານ succinct de Bruijn graph
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
ລະຫັດຫຼ້າສຸດໃນ GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo ແມ່ນວິທີການປະກອບແບບສັ້ນທີ່ອ່ານໄດ້ແບບໃໝ່ທີ່ສາມາດສ້າງຊຸດປະກອບຮ່າງຂອງ de novo ສໍາລັບ genomes ຂະຫນາດຂອງມະນຸດ. ໂຄງການດັ່ງກ່າວໄດ້ຖືກອອກແບບພິເສດເພື່ອປະກອບການອ່ານສັ້ນ Illumina. ມັນສ້າງໂອກາດໃຫມ່ສໍາລັບການສ້າງລໍາດັບການອ້າງອິງແລະປະຕິບັດການວິເຄາະທີ່ຖືກຕ້ອງຂອງ genomes ທີ່ບໍ່ໄດ້ສໍາຫຼວດຢ່າງມີປະສິດທິພາບ. SOAPdenovo2 ແມ່ນຜູ້ສືບທອດຂອງ SOAPdenovo. ອ້າງເຖິງເອກະສານທີ່ຕີພິມໃນ GigaScience (ເບິ່ງເວັບໄຊທ໌ຂ້າງລຸ່ມນີ້) ຖ້າທ່ານຕ້ອງການອ້າງເຖິງ SOAPdenovo2.
Audience
ວິທະຍາສາດ/ການຄົ້ນຄວ້າ, ນັກພັດທະນາ
ໃນການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້
ເສັ້ນຄໍາສັ່ງ
ພາສາການຂຽນໂປຣແກຣມ
C++, C
ສະພາບແວດລ້ອມຖານຂໍ້ມູນ
ໄຟລ໌ແປ
ນີ້ແມ່ນແອັບພລິເຄຊັນທີ່ຍັງສາມາດເອົາມາຈາກ https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. ມັນໄດ້ຖືກຈັດຢູ່ໃນ OnWorks ເພື່ອໃຫ້ດໍາເນີນການອອນໄລນ໌ໃນວິທີທີ່ງ່າຍທີ່ສຸດຈາກຫນຶ່ງໃນລະບົບປະຕິບັດງານຟຣີຂອງພວກເຮົາ.