Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്‌സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് പ്രൊവൈഡറിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന കമാൻഡ് ഓട്ടോഡോക്ക്ടൂളാണിത്.
പട്ടിക:
NAME
adt - AutoDockTools, AutoDock-നുള്ള ഗ്രാഫിക്കൽ ഫ്രണ്ട്-എൻഡ്
സിനോപ്സിസ്
runAdt [ഓപ്ഷനുകൾ]
വിവരണം
ഈ മാനുവൽ പേജ് നൽകിയ ഔട്ട്പുട്ടിന്റെ ഏതാണ്ട് അക്ഷരാർത്ഥത്തിലുള്ള വിവർത്തനമാണ് runAdt -h
കമാൻഡ്.
ഓപ്ഷനുകൾ
ഓപ്ഷനുകളുടെ ഒരു സംഗ്രഹം ചുവടെ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്. പൂർണ്ണമായ വിവരണത്തിനായി, കാണുക
ഓൺലൈനിൽ ലഭ്യമായ ട്യൂട്ടോറിയലുകളും ഡോക്യുമെന്റേഷനുകളും.
-h, --സഹായിക്കൂ
ഓപ്ഷനുകളുടെ സംഗ്രഹം കാണിക്കുക.
-a or --വീണ്ടും
ലാസ്റ്റ്ലോഗ് ഫയൽ തിരികെ പ്ലേ ചെയ്യുക
--ഓവർറൈറ്റ്ലോഗ്
ലോഗ് ഫയൽ തിരുത്തിയെഴുതുക
--തനത് ലോഗ്
ഒരു അദ്വിതീയ നാമമുള്ള ഒരു ലോഗ് ഫയൽ സൃഷ്ടിക്കുക
--നോലോഗ്
ലോഗിംഗ് ഓഫ് ചെയ്യുക
--noSplash
സ്പ്ലാഷ് സ്ക്രീൻ ഓഫ് ചെയ്യുക
--മരിക്കുക GUI ഇവന്റ് ലൂപ്പ് ആരംഭിക്കരുത്
--കസ്റ്റമൈസർ ഫയല്
ഉപയോക്താവ് വ്യക്തമാക്കിയ ഫയൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക
--ലിബ് പാക്കേജിന്റെ പേര്
കമാൻഡുകളുടെ ഒരു ലൈബ്രറി ചേർക്കുക
-v r, --ദർശനം ഓടുക
കമാൻഡ് ലൈനിൽ വിഷൻ നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക
-v o, --ദർശനം ഒരിക്കല്
വിഷൻ നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ പ്രവർത്തിപ്പിച്ച് ADT-ൽ നിന്ന് പുറത്തുകടക്കുക
-d or --dmode മോഡുകൾ
ഒരു ഡിസ്പ്ലേ മോഡ് വ്യക്തമാക്കുക
മോഡുകൾ ഡിസ്പ്ലേ മോഡിന്റെ ഏതെങ്കിലും സംയോജനമാകാം
'cpk' : cpk
'വരികൾ': വരികൾ
'ss' : ദ്വിതീയ ഘടന റിബൺ
'sb' : വടികളും പന്തുകളും
'lic' : ലൈക്കോറൈസ്
'ms' : തന്മാത്രാ ഉപരിതലം
'ca' : സി-ആൽഫ ട്രെയ്സ്
'bt': നട്ടെല്ല് അടയാളം
'sp' : CA-spline
'sssb' : പ്രോട്ടീനുകൾ, സ്റ്റിക്കുകൾ, പന്തുകൾ എന്നിവയുടെ ദ്വിതീയ ഘടന
ബോണ്ടുകളില്ലാത്ത മറ്റ് അവശിഷ്ടങ്ങൾക്കായി ബോണ്ട് ലൈനുകളുള്ള മറ്റ് അവശിഷ്ടങ്ങൾ
-c or --സിമോഡ് മോഡുകൾ
ഒരു ഡിസ്പാലി മോഡ് വർണ്ണ സ്കീം വ്യക്തമാക്കുക:
'ca' : ആറ്റം അനുസരിച്ച് നിറം
'cr' : അവശിഷ്ടം അനുസരിച്ച് നിറം (RASMOL സ്കീം)
'cc' : ചെയിൻ പ്രകാരമുള്ള നിറം
'cm' : തന്മാത്ര പ്രകാരം നിറം
'cdg': ഡേവിഡ് ഗുഡ്‌സെല്ലിന്റെ സ്കീം ഉപയോഗിച്ച് നിറം
'cs' : ഷേപ്പ്ലി സ്കീം ഉപയോഗിക്കുന്ന കളർ അവശിഷ്ടങ്ങൾ
'css': ദ്വിതീയ ഘടന മൂലകത്തിന്റെ നിറം
ഉദാഹരണം:
പ്രോട്ടീൻ റിബൺ ആയും, നോൺ പ്രോട്ടീൻ സ്റ്റിക്കുകളും ബോളുകളും ആയി പ്രദർശിപ്പിക്കുക, ആറ്റം തരം അനുസരിച്ച് നിറം
adt -i --dmode sssb --cmode cr myprot.pdb
adt -i -m sssb -c cr myprot.pdb
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനിൽ autodocktools ഉപയോഗിക്കുക