ഇ-പിസിആർ - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

ഇ-പിസിആർ - ഡിഎൻഎ സീക്വൻസുകളിൽ സീക്വൻസ് ടാഗ് ചെയ്ത സൈറ്റുകൾ (എസ്ടിഎസ്) കണ്ടെത്തുക

സിനോപ്സിസ്

ഇ-പിസിആർ [-hV] [posix-options] stsfile [വേഗത ...] [compat-options]

വിവരണം

ജീനോമിലെ ജോഡി പ്രൈമറുകളുടെ സ്ഥാനത്ത് പ്രോഗ്രാം സ്‌ഫോടനത്തെ മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുന്നു
ഒരു PCR ഉൽപ്പന്നം നൽകുക.

ഓപ്ഷനുകൾ

Posix-ഓപ്ഷനുകൾ ഇവയാണ്:

-m=## മാർജിൻ (ഡിഫോൾട്ട് 50)

-w=## വാക്കുകളുടെ വലുപ്പം (ഡിഫോൾട്ട് 7)

-n=## അനുവദനീയമായ പരമാവധി പൊരുത്തക്കേടുകൾ (ഡിഫോൾട്ട് 0)

-g=## അനുവദനീയമായ പരമാവധി ഇൻഡലുകൾ (ഡിഫോൾട്ട് 0)

-f=## ## അവ്യക്തമായ വാക്കുകൾ ഉപയോഗിക്കുക, ##>1 ആണെങ്കിൽ പതുക്കെ

-o=## ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ സജ്ജമാക്കുക

-t=## ഔട്ട്പുട്ട് ഫോർമാറ്റ് സജ്ജമാക്കുക:

1 - ക്ലാസിക്, ശ്രേണി (pos1..pos2)

2 - ക്ലാസിക്, മധ്യഭാഗം

3 - പട്ടിക

4 - കമന്റുകളിൽ വിന്യാസത്തോടുകൂടിയ പട്ടിക (സ്ലോ)

-d=##-## ഡിഫോൾട്ട് സൈസ് ശ്രേണി സജ്ജീകരിക്കുക (ഡിഫോൾട്ട് 100-350)

-p=+- ഹിറ്റുകൾ പോസ്റ്റ്പ്രോസസ് ഓൺ/ഓഫ് ആക്കുക

-v=## വെർബോസിറ്റി ഫ്ലാഗുകൾ

-a=a|f പ്രെസൈസ് അലൈൻമെന്റുകൾ ഉപയോഗിക്കുക (വിടവുകൾ>0 ആണെങ്കിൽ മാത്രം), സ്ലോ

a - Always or f - as Fallback

-x=+- പ്രൈമറുകളുടെ 5'-എൻഡ് ചെറിയക്ഷരം മാസ്കിംഗ് ഉപയോഗിക്കുക (ഡിഫോൾട്ട് -)

-u=+- എല്ലാ പ്രൈമറുകളും വലിയക്ഷരമാക്കുക (ഡിഫോൾട്ട് -)

compat-options (ഡ്യൂപ്ലിക്കേറ്റ് posix-options) ആകുന്നു

M=## മാർജിൻ (ഡിഫോൾട്ട് 50)

W=## വാക്കുകളുടെ വലുപ്പം (ഡിഫോൾട്ട് 7)

N=## അനുവദനീയമായ പൊരുത്തക്കേടുകളുടെ എണ്ണം (ഡിഫോൾട്ട് 0)

G=## അനുവദനീയമായ പരമാവധി ഇൻഡലുകൾ (ഡിഫോൾട്ട് 0)

F=## ## തുടർച്ചയായ വാക്കുകൾ ഉപയോഗിക്കുക

O=## ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ ## ആയി സജ്ജമാക്കുക

T=## ഔട്ട്പുട്ട് ഫോർമാറ്റ് സജ്ജമാക്കുക (1..3)

D=##-## സ്ഥിര വലുപ്പ ശ്രേണി സജ്ജീകരിക്കുക

P=+- പോസ്റ്റ്പ്രോസസ് ഹിറ്റ്/ഓഫ്

V=## വെർബോസിറ്റി ഫ്ലാഗുകൾ

A=a|f പ്രെസൈസ് അലൈൻമെന്റുകൾ ഉപയോഗിക്കുക (വിടവുകൾ>0 ആണെങ്കിൽ മാത്രം), സ്ലോ

a - Always or f - as Fallback

X=+- പ്രൈമറുകളുടെ 5'-എൻഡ് ചെറിയക്ഷരം മാസ്കിംഗ് ഉപയോഗിക്കുക (ഡിഫോൾട്ട് -)

U=+- എല്ലാ പ്രൈമറുകളും വലിയക്ഷരമാക്കുക (ഡിഫോൾട്ട് -)

- മധ്യത്തിൽ T=2 പോലെ തന്നെ

കൂടുതൽ ഓപ്‌ഷനുകളെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾക്ക് വിളിക്കുക ഇ-പിസിആർ ഓപ്ഷനുകളൊന്നുമില്ലാതെ.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് e-PCR ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക