geneparse-mpi - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

geneparse - സീക്വൻസ് ഫയൽ ലോഡർ ഫ്രണ്ട്എൻഡ്

സിനാപ്സ്

geneparse [ഓപ്ഷനുകൾ...] [ഇൻപുട്ട്] [input2 ...] #ഇൻപുട്ട് വായിച്ച് stdout-ലേക്ക് എഴുതുക

വിവരണം

ഒരു സീക്വൻസ് ഫയൽ വായിക്കുകയും അത് എവിടെയെങ്കിലും എഴുതുകയും ചെയ്യുന്നു (സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി stdout ലേക്ക്).

ഒരു ഇൻപുട്ട് ഫയലിനുള്ളിലെ ഒരു പ്രത്യേക ശ്രേണി ഫയൽ[ആരംഭിക്കുക, നിർത്തുക] പ്രകാരം വ്യക്തമാക്കാം. സമചതുരം
ബ്രാക്കറ്റുകൾ {[()]}, (ഉദാ. "genome.fa[3000,4000]" അല്ലെങ്കിൽ
"genome.fa{3000~4000}"). അവയെല്ലാം നിങ്ങളുടെ ഷെൽ പാഴ്‌സ് ചെയ്‌തേക്കാം എന്ന കാര്യം ശ്രദ്ധിക്കുക. കൂടാതെ
അക്കങ്ങൾ വേർതിരിക്കാൻ പദമല്ലാത്ത ഏത് പ്രതീകവും ഉപയോഗിക്കാം.

ഓപ്ഷനുകൾ

--repeatmask|-r
സോഫ്റ്റ് ആവർത്തിച്ചുള്ള മാസ്ക് സീക്വൻസുകൾ ഉപയോഗിക്കുക (അതായത്: ചെറിയക്ഷരങ്ങൾ N കൾ ഉപയോഗിച്ച് മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുക).

--upper|--unmask|-U
എല്ലാ അടിസ്ഥാനങ്ങളും വലിയക്ഷരം.

--നീളം|-എൽ
നീളം പ്രിന്റ് ചെയ്ത് പുറത്തുകടക്കുക

--ക്ലീൻ|-സി
പൂർത്തിയാകുമ്പോൾ ഒരു പുതിയ വരി കൂട്ടിച്ചേർക്കരുത്

--പതിപ്പ്|-വി
പ്രോഗ്രാം പതിപ്പ് പ്രിന്റ് ചെയ്യുന്നു

--help|-h
ഒരു സഹായ സന്ദേശം പ്രിന്റ് ചെയ്യുന്നു

--output|-o
ഒരു ഫയലിലേക്ക് ഔട്ട്പുട്ട് അയയ്ക്കുക (അല്ലെങ്കിൽ stdout ഉപയോഗിക്കുക). --ഔട്ട്പുട്ട് സൂചിപ്പിക്കുന്നത് --ക്ലീൻ.

--ശാന്തം|-q
എല്ലാ മുന്നറിയിപ്പുകളും നിശബ്ദമാക്കുക

--verbose|-v
ധാരാളം അധിക വിശദാംശങ്ങൾ അച്ചടിക്കുന്നു

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് geneparse-mpi ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക