maqview - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

Maqview - Maq വിന്യാസ സൂചികയും വ്യൂവറും

സിനോപ്സിസ്

maqindex -i|-v|-b [-c in.cns] in.map [ബി.സി[:തുടക്കം[-അവസാനിക്കുന്നു]] [...]]

maqview [-c in.cns] in.map

വിവരണം

മഖ്വ്യൂ അലൈൻമെന്റ് ഫയലിലേക്ക് അതിവേഗ റാൻഡം ആക്സസ് നേടുന്ന പ്രോഗ്രാമുകളുടെ ഒരു കൂട്ടമാണ്
സൃഷ്ടിച്ചത് `maq മാപ്പ്', കൂടാതെ ഒരു നല്ല GUI (ഗ്രാഫിക്കൽ യൂസർ) ഉപയോഗിച്ച് വിന്യാസം പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നു
ഇന്റർഫേസ്). വേഗത, മെമ്മറി, ഡിസ്ക് ഉപയോഗം എന്നിവയിൽ ഇത് വളരെ കാര്യക്ഷമമാണ്. മഖ്വ്യൂ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ളതാണ്
OpenGL, Mac OS X, Linux എന്നിവയിൽ പ്രവർത്തിക്കുമെന്ന് അറിയപ്പെടുന്നു. വിൻഡോസിലേക്ക് പോർട്ടിംഗ് തത്വത്തിൽ ആണ്
എളുപ്പമാണ്.

maqindex
maqindex -i|-v|-b [-c in.cns] in.map [ബി.സി[:തുടക്കം[-അവസാനിക്കുന്നു]] [...]]

-i അലൈൻമെന്റ് ഫയൽ സൂചികയിലാക്കുക

-v 'maq mapview' ഫോർമാറ്റിൽ നിർദ്ദിഷ്ട മേഖലയിൽ അലൈൻമെന്റ് പ്രിന്റ് ചെയ്യുക

-b ബൈനറി .മാപ്പ് ഫോർമാറ്റിൽ നിർദ്ദിഷ്ട മേഖലയിൽ അലൈൻമെന്റ് ഇടുക

-c FILE ഒരേ സമയം maqview-ൽ കാണുന്നതിന് Maq കൺസെൻസസ് ഫയൽ സൂചികയാക്കുക

പ്രോഗ്രാം maqindex ഒരു maq അലൈൻമെന്റ് ഫയൽ സൂചികയിലാക്കുന്നു in.map അല്ലെങ്കിൽ എല്ലാ വായനകളും വേഗത്തിൽ വീണ്ടെടുക്കുന്നു
ഒന്നോ അതിലധികമോ പ്രദേശങ്ങൾ. അതിലൊന്ന് -i, -v ഒപ്പം -b ഉപയോഗിക്കണം. വേണ്ടി -v or -b, ഒരെണ്ണമെങ്കിലും
`chrX', `chrX:1000' അല്ലെങ്കിൽ `chrX:1,000-2,000' പോലുള്ള പ്രദേശം വ്യക്തമാക്കിയിരിക്കണം. ഒന്നിലധികം പ്രദേശങ്ങൾ
അനുവദനീയമാണ്.

maqview
maqview [-c in.cns] in.map

-c FILE Maq സമവായ ഫയൽ

പ്രോഗ്രാം maqview ഒരു ഗ്രാഫിക്കൽ വിൻഡോയിൽ റീഡ് അലൈൻമെന്റ് പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നു. എപ്പോൾ in.cns is
വ്യക്തമാക്കിയത്, മുകളിലെ സീക്വൻസ് റഫറൻസാണ്, തുടർന്ന് Maq കൺസെൻസസ് സീക്വൻസ്;
അല്ലെങ്കിൽ, ഭൂരിപക്ഷ-ഭരണ സമവായം കണക്കാക്കും.

മാക്വ്യൂവിന് രണ്ട് കാഴ്ചകളുണ്ട്: സീക്വൻസ് വ്യൂ, ബോക്സ് വ്യൂ. സീക്വൻസ് വ്യൂവിൽ, സീക്വൻസുകൾ വായിക്കുക
സ്ക്രീനിൽ പ്രിന്റ് ചെയ്യും. ഇരുണ്ട ബേസ് താഴ്ന്ന അടിസ്ഥാന ഗുണങ്ങളും ചുവപ്പും സൂചിപ്പിക്കുന്നു
എങ്കിൽ റഫറൻസുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ വ്യത്യാസങ്ങൾ കാണിക്കുക in.cns വ്യക്തമാക്കിയിരിക്കുന്നു അല്ലെങ്കിൽ
ഇല്ലെങ്കിൽ ഭൂരിപക്ഷ-ഭരണ സമവായം. ബോക്സ് വ്യൂവിൽ, വ്യത്യസ്ത തരം ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ ഉണ്ട്
A-യ്‌ക്ക് പച്ച, C-യ്‌ക്ക് സിയാൻ, G-യ്‌ക്ക് ഓറഞ്ച്, T-യ്‌ക്ക് ചുവപ്പ്, ഇരുണ്ട നിറമുള്ള വർണ്ണ ബോക്‌സുകളായി പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു
N-ന് ചാരനിറം. നിറങ്ങളുടെ സാച്ചുറേഷൻ അടിസ്ഥാന ഗുണങ്ങളെയും കനം വരകളെയും സൂചിപ്പിക്കുന്നു
വായനകളുടെ റീഡ് അലൈൻമെന്റുകളുടെ മാപ്പിംഗ് ഗുണങ്ങൾ കാണിക്കുന്നു. സൂം ഇൻ/ഔട്ട് മാത്രം പിന്തുണയ്ക്കുന്നു
ബോക്സ് കാഴ്ചയിൽ. രണ്ട് കാഴ്‌ചകളിലും, വിൻഡോയുടെ ചുവടെയുള്ള സ്റ്റാറ്റസ് ബാർ ചിലത് കാണിക്കും
പ്രധാന സ്പർശനങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾ, കൂടാതെ മൗസ് ചൂണ്ടിക്കാണിച്ച പേരുകളും അടിസ്ഥാന ഗുണങ്ങളും വായിക്കുക.

അലൈൻമെന്റ് നാവിഗേറ്റ് ചെയ്യുന്നത് വിവിധ കീ ബൈൻഡിംഗുകൾ വഴിയാണ്.

· പ്രധാന ബൈൻഡിംഗുകൾ:

? ഡിസ്പ്ലേ സഹായം
പുറത്ത്
സീക്വൻസ് കാഴ്ച
ബോക്സ് കാഴ്ച
p മുമ്പത്തെ റഫറൻസ് സീക്വൻസിലേക്ക് മാറുക
n അടുത്ത റഫറൻസ് സീക്വൻസിലേക്ക് മാറുക
r പുതുക്കുക

ചൂണ്ടിക്കാണിച്ച സ്ഥാനത്തേക്ക് നീങ്ങുക
h / ഒരു അടിത്തറയിൽ ഇടത്തേക്ക് നീക്കുക
l / ഒരു അടിത്തറയിലൂടെ വലത്തേക്ക് നീങ്ങുക
കെ / ഒരു വരിയിലൂടെ മുകളിലേക്ക് നീങ്ങുക
j/ ഒരു വരിയിലൂടെ താഴേക്ക് നീങ്ങുക
> അടുത്ത വായനയിലേക്ക് നീങ്ങുക
< മുമ്പത്തെ വായനയിലേക്ക് നീങ്ങുക
g / നിലവിലെ റഫറൻസിന്റെ തുടക്കത്തിലേക്ക് നീങ്ങുക
ജി / നിലവിലെ റഫറൻസിന്റെ അവസാനത്തിലേക്ക് നീങ്ങുക
നിങ്ങൾ / ഒരു പേജ് ഇടത്തേക്ക് നീക്കുക
/ ഒരു പേജിലൂടെ വലത്തേക്ക് നീങ്ങുക
100 അടിത്തറകളാൽ നീങ്ങുക
1000 ബേസുകൾ വഴി നീങ്ങുക

+ ഒരു പുതിയ കാഴ്ച ചേർക്കുക
- നിലവിലെ കാഴ്ച നീക്കം ചെയ്യുക

വലത് ഓട്ടോ-സ്ക്രോളിംഗ് ഓൺ/ഓഫ് ടോഗിൾ ചെയ്യുക
^b ഇടത് ഓട്ടോ-സ്ക്രോളിംഗ് ഓൺ/ഓഫ് ടോഗിൾ ചെയ്യുക
+ സൂം ഇൻ ചെയ്യുക
- സൂം ഔട്ട്
0 ഡിഫോൾട്ട് സ്കെയിലിലേക്ക് സൂം ചെയ്യുക
q മാപ്പിംഗ് ഗുണങ്ങൾ കാണിക്കുക/മറയ്ക്കുക
ഇ ഡിസ്പ്ലേ SE/PE മാപ്പിംഗ് ഗുണങ്ങൾ ടോഗിൾ ചെയ്യുക
o ഒരു പുതിയ അലൈൻമെന്റ് ഫയൽ തുറക്കുക

· ഒരു പൂർണ്ണസംഖ്യ നൽകുക, തുടർന്ന് അമർത്തുക ആവശ്യമായ സ്ഥാനത്തേക്ക് ചാടാൻ.

· ഒരു പൂർണ്ണസംഖ്യ നൽകുക, തുടർന്ന് മറ്റൊരു കീ അമർത്തുക വഴി സ്ക്രോളിംഗ് വേഗത്തിലാക്കാൻ
നിർദ്ദിഷ്ട ഘടകം.

· ക്രമത്തിൽ നീങ്ങാൻ ചതുരത്തിലുള്ള മഞ്ഞ ക്രോസ് ഇടത് ക്ലിക്ക് ചെയ്ത് വലിച്ചിടുക. ശരിയാണ്
ഒരു കോളം ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യാൻ റഫറൻസിൽ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് maqview ഓൺലൈനിൽ ഉപയോഗിക്കുക