ലിനക്സിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ kSNP എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് kSNP3.1_Linux_package.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
OnWorks-ൽ സൗജന്യമായി Linux-ൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ kSNP എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ലിനക്സിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിക്കാൻ kSNP
Ad
വിവരണം
kSNP ഒരു കൂട്ടം ജീനോം സീക്വൻസുകളിൽ പാൻ-ജീനോം SNP-കളെ തിരിച്ചറിയുന്നു, കൂടാതെ ആ SNP-കളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി ഫൈലോജെനെറ്റിക് മരങ്ങൾ കണക്കാക്കുന്നു. എസ്എൻപി കണ്ടെത്തൽ കെ-മെർ വിശകലനത്തെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ളതാണ്, കൂടാതെ ഒന്നിലധികം സീക്വൻസ് വിന്യാസമോ ഒരു റഫറൻസ് ജീനോമിന്റെ തിരഞ്ഞെടുപ്പോ ആവശ്യമില്ല, അതിനാൽ kSNP ന് 100 മൈക്രോബയൽ ജീനോമുകൾ ഇൻപുട്ടായി എടുക്കാൻ കഴിയും. ഒരു സെൻട്രൽ എസ്എൻപി അല്ലീലിന് ചുറ്റുമുള്ള കെ നീളമുള്ള ഒലിഗോയാണ് എസ്എൻപി ലോക്കസിനെ നിർവചിക്കുന്നത്. kSNP-ക്ക് സമ്പൂർണ്ണ (പൂർത്തിയായ) ജീനോമുകളും പൂർത്തിയാകാത്ത ജീനോമുകളും അസംബിൾ ചെയ്ത കോൺടിഗുകളിലോ അസംസ്കൃതവും അസംബ്ലിഡ് റീഡുകളിലോ വിശകലനം ചെയ്യാൻ കഴിയും. പൂർത്തിയായതും പൂർത്തിയാകാത്തതുമായ ജീനോമുകൾ ഒരുമിച്ച് വിശകലനം ചെയ്യാൻ കഴിയും, കൂടാതെ kSNP-ന് പൂർത്തിയായ ജീനോമുകളുടെ Genbank ഫയലുകൾ സ്വയമേവ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാനും ആ ഫയലുകളിലെ വിവരങ്ങൾ SNP വ്യാഖ്യാനത്തിൽ ഉൾപ്പെടുത്താനും കഴിയും.ഗാർഡ്‌നർ, എസ്‌എൻ, ഹാൾ, ബിജി 2013. പൂർണ്ണ-ജീനോം വിന്യാസങ്ങൾ പ്രവർത്തിക്കാത്തപ്പോൾ: നൂറുകണക്കിന് മൈക്രോബയൽ ജീനോമുകളുടെ അലൈൻമെന്റ്-ഫ്രീ എസ്എൻപി കണ്ടെത്തലിനും ഫൈലോജെനെറ്റിക്‌സിനും വേണ്ടിയുള്ള kSNP v2 സോഫ്റ്റ്‌വെയർ. PLoS ONE, 8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760
https://sourceforge.net/projects/ksnp/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണിത്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
