Ini ialah perintah demux yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
demux - Tukar sekatan jarak XPLOR kepada format Gromacs
SINOPSIS
demokrasi md0.log tambahan
DESCRIPTION
Jika anda ingin menjadikan trajektori anda berterusan sekali lagi anda boleh gunakan demokrasi untuk membaca
fail md0.log anda (anda boleh menggabungkan beberapa jika perlu) dan menghasilkan beberapa output
fail. Salah satu daripadanya ialah fail .xvg (replica_ndx.xvg) yang boleh dihantar kepada trjcat(1) bersama-sama
dengan fail trajektori asal, untuk menghasilkan trajektori berterusan. Yang lain
fail (replika_temp.xvg) mengandungi suhu untuk setiap replika, bermula pada
suhu asal. Jadi jika replika minat anda bermula pada, katakan, 300 K, anda boleh mengikuti
trajektorinya melalui ruang suhu. Ia akan menjadi menarik untuk menambah beberapa
kefungsian untuk membuat histogram taburan suhu bagi setiap replika, yang
menurut kebanyakan pengarang, harus rata. Trajektori demux boleh digunakan dengan
g_kinetik(1) untuk mendapatkan kinetik lipatan protein daripada trajektori REMD.
PILIHAN
md0.log Fail log larian trajektori yang anda ingin buat berterusan. Berbilang fail boleh
dilampirkan bersama.
tambahan Bilangan kali setiap entri dalam fail log akan disalin. (Integer)
HADAH
Jika pertukaran anda adalah setiap N ps dan anda menyimpan setiap M ps yang anda boleh buat untuk yang hilang
bingkai dengan tetapan tambahan kepada (N/M - 1). Jika N/M bukan integer, anda tidak bernasib baik dan anda
tidak akan dapat mendemux trajektori anda sama sekali.
Gunakan demux dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net