Ini ialah perintah fastaq-to_perfect_reads yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
fastaq_to_perfect_reads - Buat bacaan berpasangan yang sempurna daripada rujukan
DESCRIPTION
penggunaan: fastaq_to_perfect_reads [pilihan]
sisihan>
Menjadikan bacaan fastq akhir berpasangan sempurna daripada fail jujukan, dengan saiz sisipan sampel daripada
taburan normal. Orientasi membaca adalah innies. Output ialah fail FASTQ berjalin.
kedudukannya hujah:
infile Nama fail input
fail luar
Nama fail output
min saiz sisipan
Min saiz sisipan pasangan baca
masukkan sisihan std
Sisihan piawai saiz sisipan
bermakna liputan
Min liputan bacaan
panjang baca
Panjang setiap bacaan
pilihan hujah:
-h, - membantu
tunjukkan mesej bantuan ini dan keluar
--serpihan NAMA FAIL
Tulis urutan serpihan FASTA (iaitu baca pasangan tambah urutan di antaranya)
kepada nama fail yang diberikan
--no_n Jangan benarkan sebarang N atau n aksara dalam bacaan
--benih INT
Benih untuk penjana nombor rawak. Lalai adalah menggunakan lalai python
Gunakan fastaq-to_perfect_reads dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net