Ini ialah apl Linux bernama Gen3D untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai gen3d.cpp. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama Gen3D ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
Gen3D untuk dijalankan di Linux dalam talian
DESCRIPTION
Gen3D ialah aplikasi yang direka untuk menentukan model genom dan kromosom tiga dimensi. Ia menggunakan data hubungan kromosom untuk membina konformasi tiga dimensi. Kaedah ini boleh menjana model kromosom tiga dimensi yang memenuhi sebahagian besar hubungan kromosom.Perisian ini dibangunkan di Makmal Bioinformatik, Perlombongan Data dan Pembelajaran Mesin Prof. Jianlin Cheng di Jabatan Sains Komputer di Universiti Missouri - Columbia, Amerika Syarikat. Projek ini disokong oleh Yayasan Sains Kebangsaan (geran no. DBI1149224).
Jika anda menggunakan Gen3D dalam penyelidikan anda, sila petik:
Nowotny, Jackson, Sharif Ahmed, Lingfei Xu, Oluwatosin Oluwadare, Hannah Chen, Noelan Hensley, Tuan Trieu, Renzhi Cao, dan Jianlin Cheng. "Pembinaan semula berulang model tiga dimensi kromosom manusia daripada data hubungan kromosom." BMC bioinformatik 16, no. 1 (2015): 338.
Ciri-ciri
- Gunakan data hubungan kromosom yang diperoleh menggunakan teknik Hi-C
- Bina genom struktur 3D dan model kromosom daripada data hubungan kromosom
- Mulakan koordinat menggunakan pendekatan kebarangkalian
- Kaedah baru untuk mewakili kenalan yang berpuas hati dalam matriks peta haba
- Skim pemarkahan untuk mengetahui kenalan jarak jauh dan jarak dekat
- Berbanding dengan kaedah sedia ada lain dan juga disahkan dengan ciri genom
Penonton
Sains/Penyelidikan, Kejuruteraan
Bahasa Pengaturcaraan
C + +
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/gen3d/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.