Ini ialah apl Linux bernama trj_cavity untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai trj_cavity_v2.1.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama trj_cavity ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
trj_cavity untuk dijalankan dalam Linux dalam talian
DESCRIPTION
trj_cavity mencari rongga protein di seluruh trajektori simulasi Molecular Dynamics (MD). Program ini berfungsi dengan fail dalam format PDB, tetapi ia juga boleh membaca/menjana format serasi GROMACS seperti XTC.Projek yang sama boleh disusun sebagai alat GROMACS atau sebagai versi kendiri. Arahan pemasangan disediakan dalam fail INSTALL projek dan dalam https://sourceforge.net/p/trjcavity/wiki/Home/#ffad
Jika anda memerlukan sokongan menggunakan alat ini (atau laporkan pepijat), sila siarkan dalam forum perbincangan.
Catatan: v2 berjalan selari dan menyokong siri GROMACS v5.1+. Jika anda ingin terus menggunakan GROMACS v4.x, sila gunakan trj_cavity_v1.1.
Ciri-ciri
- Cari rongga protein dalam trajektori simulasi MD.
- Menghasilkan trajektori MD rongga protein vs masa.
- Menyediakan statistik taburan rongga protein.
- Mengira deskriptor isipadu rongga.
- Profil jejari terowong liang paksi biasa.
Bahasa Pengaturcaraan
C + +
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/trjcavity/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
