Ini ialah apl Linux yang dinamakan Visualisasi Graf Protein-Ligan untuk dijalankan dalam Linux dalam talian yang keluaran terbaharunya boleh dimuat turun sebagai vplg_2016_07_18.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama Visualisasi Graf Protein-Ligand ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
Visualisasi Graf Protein-Ligan untuk dijalankan di Linux dalam talian
DESCRIPTION
Pakej perisian Visualisasi Graf Protein-Ligand (VPLG) mengira dan memvisualisasikan graf protein. Ia berfungsi pada tahap struktur super-sekunder dan menggunakan koordinat atom daripada fail PDB dan tugasan SSE bagi algoritma DSSP.VPLG ialah perisian baris arahan. Jika anda tidak suka menaip arahan, cuba pelayan web PTGL kami: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Ciri-ciri
- Membaca data atom 3 dimensi daripada fail PDB dan tugasan struktur sekunder daripada fail DSSP
- Mengira graf protein-ligan daripada data dan menggambarkan graf
- Menyokong output imej graf dalam format bitmap (.png) dan vektor (.svg).
- Mengeksport graf protein-ligan dalam fail teks biasa dalam format tersendiri (.plg) yang mudah diedit, dihuraikan dan dijana dengan program komputer serta dalam beberapa format fail graf standard
- Boleh membaca dan menggambarkan secara langsung graf protein daripada .plg-files
- Perisian Sumber Terbuka Percuma (FOSS)
- Sokongan pangkalan data (pilihan sepenuhnya, tiada pelayan pangkalan data diperlukan secara lalai)
- Antara muka baris arahan membolehkan pemprosesan kelompok mudah melalui skrip shell
- Membenarkan penapisan ligan mengikut nombor atom
- GUI baharu yang ditulis dalam Java, tidak perlu menaip arahan konsol lagi!
- Perisian yang memberi kuasa kepada pelayan web PTGL: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Penonton
Sains/Penyelidikan, Pendidikan, Pengguna Akhir Termaju
Antaramuka pengguna
Java Swing, Konsol/Terminal, Baris Perintah
Bahasa Pengaturcaraan
Java
Persekitaran Pangkalan Data
JDBC
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/vplg/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
