Ini ialah apl Linux bernama EigenMS untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai EigenMS.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama EigenMS ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
EigenMS untuk dijalankan di Linux dalam talian
HURAIAN:
EigenMS ialah kaedah normalisasi yang dilaksanakan dalam R (dan versi lama dalam Matlab) tersedia sebagai satu set dua fungsi yang harus digunakan dalam urutan.Sila muat turun fail EigenMS.zip (versi terkini).
Versi terbaharu yang dimuat naik pada Oktober 2017 mempunyai pembetulan pepijat untuk normalisasi kumpulan rawatan tunggal.
Penskalaan semula telah diabaikan dari 2015.
EigenMS menggunakan SVD untuk mengesan arah aliran berat sebelah dalam data dan menghapuskannya. EigenMS menghapuskan kesan daripada faktor yang diketahui dan tidak diketahui dan boleh digunakan untuk mana-mana platform -omic.
Kami telah menunjukkan kegunaannya dalam LC-MS/MS dan metabolomik dalam dua kertas berikut:
1) PMID: 19602524. "Normalisasi keamatan puncak dalam proteomik berasaskan MS bawah ke atas menggunakan penguraian nilai tunggal".
Karpievitch YV, Taverner T, Adkins JN, Callister SJ, Anderson GA, Smith RD, Dabney AR.
Bioinformatik 2009
2) "Penormalan data Metabolomik dengan EigenMS"
Karpievitch YV, Nikolic SB, Wilson R, Sharman JE, Edwards LM.
PLoS One 2014
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
MATLAB, S/R
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/eigenms/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.