Ini ialah apl Linux bernama SnowyOwl yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai SnowyOwl-2.0.3.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama SnowyOwl ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN:
SnowyOwl
HURAIAN:
SnowyOwl ialah saluran paip ramalan gen yang menggunakan data RNA-Seq untuk melatih dan memberikan petunjuk bagi penjanaan ramalan gen berasaskan Model Markov Tersembunyi (HMM) dan untuk menilai model yang terhasil. Talian paip telah disahkan dan diperkemas dengan membandingkan ramalannya kepada model gen yang dipilih secara manual dalam tiga genom kulat, dan keputusannya menunjukkan peningkatan yang ketara dalam kepekaan dan selektiviti berbanding ramalan gen sebelumnya. Kepekaan diperoleh dengan berulang kali menjalankan peramal gen HMM Augustus dengan parameter input yang berbeza-beza, dan selektiviti dengan memilih model dengan homologi terbaik kepada protein yang diketahui dan persetujuan terbaik kepada data RNA-Seq. SnowyOwl telah berjaya meramalkan gen dalam 26 genom kulat novel.
Saluran paip boleh dipasang secara tempatan untuk daya pemprosesan yang tinggi dan kawalan ke atas konfigurasi. Ia juga boleh dijalankan pada pelayan jauh melalui antara muka web yang mudah untuk kegunaan sekali-sekala.
Ciri-ciri
- Ramalan gen menggunakan data RNA-Seq
- Kepekaan dan kekhususan yang tinggi
- Saluran paip diperkemas dan disahkan dengan model gen yang dipilih susun secara manual
- Sangat boleh dikonfigurasi
- Konfigurasi lalai untuk kulat ascomycete dan basidiomycete
- Pasang dan jalankan secara tempatan untuk kawalan dan fleksibiliti
- Jalankan dari jauh melalui antara muka web untuk kemudahan
Penonton
Sains/Penyelidikan, Pengguna Akhir Termaju
Antaramuka pengguna
Berasaskan web, Command-line, GTK+
Bahasa Pengaturcaraan
Python, PHP
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/snowyowl/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.