Dit is het commando kmc_tools-counters_subtract dat kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
kmc_tools-counters_subtract - bereken de aftrekking van tellers van twee KMC-databases
KORTE INHOUD
kmc_tools tellers_aftrekken <output
[uitvoer_params]>
PRODUCTBESCHRIJVING
De uitvoerdatabase zal alleen k-meren bevatten die aanwezig zijn in de eerste invoerset en
hebben tellers hoger dan de juiste k-meren in de tweede set. Voor elke k-mer de
teller is gelijk aan het verschil tussen de teller in de eerste set en de teller in
het tweede stel.
OPTIES
Voor elke ingang zijn er aanvullende parameters:
-ci
sluit k-meren uit die kleiner zijn dan keer
-cx
sluit k-meren uit die meer voorkomen dan keer
Voor uitvoer zijn er aanvullende parameters:
-ci
sluit k-meren uit die kleiner zijn dan keer
-cx
sluit k-meren uit die meer voorkomen dan keer
-cs
maximale waarde van een teller
VOORBEELD
kmc - k28 bestand1.fastq kmers1 tmp
kmc - k28 bestand2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools counters_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_counters_subtract
Gebruik kmc_tools-counters_subtract online met behulp van onworks.net-services